result

Gene information

Detail information of g150996

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g150996	Scaffold_44356:HRSCAF_427442	625246	635536	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g150996.t1
ATGGCGTCAGATAACTCTAGGCTCGAGGAGGAGGTGGCCGGATCAATGGGTTCGATGAATGCCACGTCAGTAGTTTTTGACGGCAAGAAGATACGAAAGCCATACACGATTACCAAATCTAGAGAGAGCTGGACTGACGAAGAGCACGATAGATTCATTACAGCTCTGCGTCTGTAAGTTTTTCTTTTGTTTCTTGGCGCGGTTGCTGAAGTAGGAAATTTAATTTGATTTTTCCCTTTAAATCATCTAGAGTACATGTGATGATCCGAATAGTTTGTAATATTTTGATCCCCTCAAATATTCCGTTTTAATAATTCTCGGATTGTGACTGTCCAAAATATAGTTCTGTAAGTTTGTACGTAGAAACTGATTAATATTTTCGATAGTATTTTGGAGATATATGAAATGATCACTTCTATTTTTGTTTAATGGGCTATATTCTACACTCCATAAGCTATGGTTGTCTGATCATTTATAAGTTTAAGCAAGAAATGTTATTTGGATAGACGTGTACAGTGCATAAATTATCAACATACCAAATGTTATTTGGATAAACTGTTTTGTATCCGTGCTCATAAATTATATTTTTATTCATATGCTTTCAAATCATATAATTGTTTATGAAATAATAATATGTATAGTTGTTTATGAAATGATATGGGGAAAGTTAGACAACAACTTACCCATAACCCTTCTTTTTGCATGTCAATTTAATCATAACTGATCATAAAACACGGATGTAAAATTTTTGATAAAATTTCTAATATTCTGGGTTGAAATTTAGTTATATGAATGGAAGCACGCTATTTGATATAAGAATGCCTGGCATGTCCATTGTATAGGCGAAAAGCCTCAGAAATTGTGATGTATGAATAGGACGATATGGATATGGACAAACTTACAAATATCTTGTAAAGACAAACAAGTTAGAAGAAGAGGAACTCTAGATTCAGAGTGAGGTATAGCAGGGAGAAGCCAGCTGACTGCATGGCACAGAAGAAGAAAAAAAGGAATAATAATAAACCTGCGTCATGTATATTTTCCTATTTATGTGTGGTGCACATTTCAACCACATAATTAATTCACCTACAGGTGTGAATTCATTCTTTCATGTCTGAGATAACTAAATCCAGATTTAGTAGTTTAGAACTGAGAATACATGACTGCTGCTAAAAGTCTAGTAACATAACACTATTGCCTGTGTGCACGTTTTTATGCTTAAGTTCTTTCCGCATTCTACTGCATGAATCTTCTAGTTCTACTAATAAACCTTCATAGTGTTGCATTGTTTTATAAAGTCGATCAATTTTCCCCGACCACTTTATTATAAATTGTACTATTGACCGGTCATTTTTTGTACCAAGATCAAAGGTTTCACACTGTGATTGGAATATTTTTCAGATTTGATCGTGATTGGAAGAGTATTGAAGAATTTGTTGGAACAAAGTCAGCTATCCAGGTATAATCCATCAACGATTTCATGCAAGTCAGAACGATCATAATGAGTATAAAATATACTGTAATAACATTATCACCTTGTGAAAGTAATAATAACTATATTCATGAACACTTCATTTATATTCATCTACTCCTCTTTTTTTTCCACATAAATTTTTTGCAAATGAATTTTAAAAATGTTCCGCGTTCCAACTAAACGTATTCCGTCTTGGCAAAGTGTTCCATTAAGGTCTACTCCTAATGCATTACATCTCACAGAATGTAATATTTTTCATTCTCGTTTTGTTTCGCGTACCACATCGATCTATGTTCCAGGTAAAATAAATTTTTATTACAAATGTGAATTTCGGGTTGTTTTACATTTGACAACTAGTCTTATGGACATGTCATGCTATAATATGTTCATAATCAGCTCACCTAAATATCCTTCTTTGAGTCACTTGAGTCGCCTATATAATTTGTAAAAACAGGTTACCTCTAAGACATGTAGCCAAGCTAGACTCTTAAGCCTTAAGCAATTTTTTCCAATGAATTTCTGATATTAATAACACATGACAAGTTTATGTATATCAGTAAAGCAGAATTGTTTAACTACTCATCAATTGTTAACTTGTATATGTAGCAAATAATAATCAATCACCATAACAATAAACATAATGTAAAAAAATAAATAAATCAAACTTAATGATTTTTATATTGGTTTTGTATATTTAATTCTACGTCCGAGTCCTATATCAAATTATATTCAGACACCATAAATCACTTTGCCTACATCATTAATGTTTAACGAGATTTTATTGCATGTGCAACGCACGTCCATGTAAAAAATTCTTGTAAAATTTAAAATTTCTGTGTATTTGATAAAATTAAACCAAAAATATGAAGAAAAATTTGTAATTTTTTCGTTGGAATGGAATTTTGAACTTTTAACCTTAGTTACATTTCAAAAAATTTATTTGAAAATAGATATTAATATTCATTCATTGTGGAATTCGTACTAGTATCTCTTGTTTGCATATAAGGTTAGTTTTGAAACTTCGCGGTCGGAGCAAAAAAATTGGGTCTACATTCCAACTATTAATAAAGATAAAATTAAGGACAAAAAATGCCCTTATAATGTAACAGCGTTAAATTCAAACTTTATATTTAACATTTTTAAATTCAAAACTTAAATTTCATTCAAACCATTTTAAACATTAATTTCTAACGGTTTTAATTCAAGGTTAAACTCAATGTTTTGACTTAAAATCATATTTTAATTCAAAGTTTAAACTTTAACATCAGAATTTTAATTCAGAGTTCAGAGTCATAGTTTTAAATAAAAAAGTTTACATGTGAAACTTGTAGTTTTAACTTCACAATGATATTTAAGGTTTGAGGTTTTAACTGGAACCTCAAAATTCCGACCATCCCTATTCTGTTCCGATCGTCGTTGGACGAAACCCTAGTTGAAACCATTTTGGTTGAGATATTGGATTTATTATGTAAACATTGATTAATGGAAAATGAAATAGATCAGTCATGAGAAGGAAGAAACATAAGATAAGCATAAAAAATCATTAATTTGATTGAAAGATTAAATAATAATCAATGGACCATAAGATATGTATGTTGCAAATCCGTGAAGAATAATCAATGGACTGCAAGATCTTTATGTTGCAAATCCGTGAAGAATATGATTGAAAGAGCATGGATTTGCAATCTTTAGATTATATTTTGATTCAAAAAAAATTAGAGTGATGAAACATGAATTGATGAAGTTTTATGTGTTTTCTTCGAATAAACTTCCAAATTCAGAAGTTTTTAACTAGTGGTGTAAGGTTGCAGCCATTCGCGAAGAGTTGCATTCATTTGAATTAAAATTTGAATGCAAAACCAGGTATGTCAGCGAATGCTTTCGGATGTAGATAGTGTCATATCCGCATCCGCGGATACGGATACAGACGGATATCAGATGATTATCATATCCGTTAACAATCTATAAATCAAGAATTATAAAAAGAAAATTTTAGTTTAACATAAATATTTTTCAATCTCATTGTAAAAGTGTTAAAAGTTTAACAAATATGATGATAATCGATCATTTCAAGCAGTTAATAAGTATTAAGTGCATATAATATGAACTACTAACTTAATAAAATAATAAATGAATATCATTTACTGCATTAAAATACACATAATTTGAATTATAATCTTGACATAAACTGGACGGATAATTTTTGGATCCGGATGTTTTCGTATCTGCATTCGCATCCGTTTTTTCGAATATCGGATATTTATCCGCTTTTCGGATGCGGATGCGGACGGATTTCAGATTTTTCAGGTATCCATTGACAGCCCTATTCAAAACTCAGAATTGTGTATTGTATGTTGACAGACCTGAGAGAATCTGTCGATATACATATCAATGAAGTGCCTTTTTGCTTTAAAACAATATAAAAAAGCAGAAACAGCCAGAAAAATATGTTCAACATTCTGGAAGATAATGCGAATATGGATACTATGGTGGATTCGAACAAAGTTTCTAAGACACATTACTCATTAAACACTTGACATACTAGTTCACTTGAAGCATACTTGTGTTTGTGAGCTTTGATTGTATTCCTGCACTTTCCCTGATAAGTAGTTAGTACCACGACTTGTATGGTTGTTATCATTAAAACATAACATCACGATTCTAACCTAATTATCTTCAGTATGTGTTGAATTATGCTTTTATAATGTGATGCATGTAGATAAATATTATGGGTTTGGATCATATTCTAGCATAATATTAGCACAATCATTATTGCTTTCACCTGTAACATTTGGATTGCAACACTACACTTAGTTGGATATTCTTTAACCTCTAGAATCGATCCTCGAAAAAAATTACGTTATCCCATGTTGAGCATATCTTGCCATCTAACTTTGAAAGAAATATGTTATATATAATTTGTTTTTAGTGTTCACAACTGCCATAGTTGCAAGATCTCTAGATGTTTTCAAAATTTCTACCTGAGTCTAGTAGATCATCTTACCACCTAATTCTATAATCTTCAATATTCAAAAGAAATTAATGAAGCTAGTCATGTAGTTTAGTTTTTTGTATTCTTTTCTTTTCTTTCAGCAAGCAAAAATATCTTAAAGTGAGCAAACAAAAACGGACTGGGGTTCATAGTTTGTTCCTTCCTTCCATAAAAAATGATAGCACATTCCCTGGTACAAGATGAGAAATAACATGACAAAATCATAGAATATCGATTTGAATCACTCGCCATGCAACTCAAATATAATCAGCAATTTAGCATGATTGTTTGCAACATATTTTTGAATGACAGTCAACGCTTAAGATAGGCAGGGAACACTTACAATCGTGTCTTGCGCAAGTTAAGACAATATATTTCATTAGATGACGTCCCCATTGCAGTGTTTATTCTTCGGTATATTCCTACATGACAAAGTTCTTTTACATGATATTGGATATATATTTGTAAACATGTTGATGCACATGCTTTTATCGCAGATAAGGAGCCATGCACAAAAGTATTTTTTAAAGGTCC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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020263026.1	5.3e-51	protein REVEILLE 6-like
Swissprot	C0SVG5.1	2.5e-37	Protein REVEILLE 5
trEMBL	A0A1U8BIP1	2.0e-47	protein REVEILLE 6-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G01280.2	57.25	1e-40	164		Homeodomain-like superfamily protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g150996	AT4G01280.2	138	44	2	30	166	48	171	57.25	1e-40	164
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g150996.t1
Allium fistulosum	AfisC4G04969
Allium sativum	Asa4G03333.1; Asa5G04258.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	41	85	43.7	2e-11

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0001101	P	response to acid chemical
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GO:2001141	P	regulation of RNA biosynthetic process
GO:0140110

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network