result

Gene information

Detail information of g156316

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g156316	Scaffold_45115:HRSCAF_428201	1	8227	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g156316.t1
ATTATGTTTTCCAAATTGAGGATATGGAAAAGTACCTTCCATTTAAACTTTGTGAAGGTTGTTGGAACTCGATATGAGTGTCCATTTGAAAATTGTAGCTACGTAGTATTTCCATTAGTTGGAGTGACCATTTTTATTTCCATTAGTTGGAGTGACCTTTTGTATTTCCATTAGTTGGAATGTCCTTTTGGACTGGTATCCCTCATGGTGGATCATCATGATGGGATAGTGTACTAGCGTAATTCGAGGGGCGAGATGCCTACGGTAACAAGCGATTCTACTGGGATAGTAGCGTAACCGCCGTGTATACCGCGATCTAGTTACACTCGGGTAGTAGCGAAATTTTAGGGGCGTGATGCCTATAGTTACAAGCGATTCCACTGGGATAGTGGCATAACCGTCGTGTAAACTACAATCTAAAAAGCAAAGCGTAATTCGAGGGGAGAGATGCCTACGGTCACGAGCGATTCTACTGGGATAGTAGCATAACCGCCGTGTGAATCGCGATCTTTGGAAACAACCATGGCGAAATTCAAGAGATGAGAAATCTACAGTTACGAGCGATTTTACTGGGATAGTAGCGGAACCGCCGGGTGAACTGTGATCCATGGGGGAATGTGCTTTCCATATCCATTTTTTTAAAAGTATTTTTAAAAGTATTTTCACTGGGAATTGAAGCAAGTATATTTAGTACTTGGAGATTGTAGACTTGCGCCTGGCCAGCGTACCTAATGTCTTAAGAACGACAATAGACTTGTAAATTTCGAGTTATCAAGTATTTTCAAACTTTAAATAGAAAATCAATTATCTGAATTAAAGTGATGTAATCAACCTATGAATTAAGAAGAGGATTTTTGAAATGTTTTGAAAAATCCACAGCTTTGGAAAAGTTATAATATGTAAAATTTCTTAAATGTAGTGTTTCAAATTTAAAATTTGGGTTTTGTAAGTTGAAATTTTAGTAAAAGATTTTTGTGTCTTGATTGTAGAAATAATAGACAAAAGAGTTAATTAGCAAAAGCTAGCAAGATAAAACAAATAGAATGAATCCTATATTCATTCATCTTTAATAAGTGTTGAACTTGATAAAAATTGAGTAAAATATAAATATTAGTGAAATTTTAACAATCATTTTTTCCTTACTTGCAATCATTTTTTCCTTACTTGTAATTTCGGGACGAAATTCTTTTAAGGAGGGGAGATTGTAACGATCCTAAATTTTGAACAATTTAAATTGTGAATATTTAATTAATTTTGAATATTTGAATGATAATTTAAACTGAATTTCGATATAACAATGAAATTGGTGATTAAATATTTTAAAATTTAATCTATTTAAAGTTGAATAAAATGTGAATTTGACTTTCGAGTTTGAAATTGAATGATTGAATTGATATTTAAAAATTCGAACTAGTGAATTAGAAAAATAAATTGGATATAAGAATTATTATTTATGAAAATTTATAAATTGATGGTAGATTTTAAAATAACCTTCTTTAACTAAAATAAAAAGGAATAAATTTTATCAATACAAAATACAAGAACAAAAAACTAATGGGAAAACGTGTTAATATAAATAAATTTTTGATAGTTAAACTTTAAAATGTTTATATATTTACTAAAGGAAATATATACAAAATAAATTGAAATTGAAGTGAAAAAAAAAATTTATTAAAGTATAAGTAAAATAATAATAATGAAAAAAAATATAGCATGGTACCTTAGTATTAAATGCAGCCACCCTGCAAGTTGGAAAAATCACCCTAAACCCACGCCCCCTCCCCTTTATTCATTCGTTCATTTCTAAACCCTAGTTCTATAAAATAACATACGAGAAATAATGGCGGCCTCTCAAAAAATCATCTTTCGTTCCTTCTTCATTCGTTCTGCTTTGCAAAATTAGGGCTTTCGTGAAAATTGGGGATGCCGCGACTTCAAATTGTTCGACTACTTCGAATTTTGGTCGAGCTCGAGTATGCTTCGGCTGCTTCGATTTTGCAATGGTGAGTTTCTAGCTCACGATTAATCTTCATGCAAGTGCTTATATTTGTTGGATCGAATATTGGTTGCATGCTATGTTTTGGGGTGATTTTGTTATCTTTTGCTCGGCTAATTTAATTTGAAACTGATATGGGTAGATTGGCTACTGCATGTTGGATTTTCGGTTGCTATTTGCTGTCATTTGCTCGATTTGCTTGAATTGTTAAACTGTTAAGAACAGATGGTACCCAATTTTTAAACTGATAAACCATTGACGCTTTCAAAAATTTGTTCTTTTTTAAATTTATAAAAACAAATGCTATTTGATTTTTGTTTAAATTGATAAAACAGATGCTGCCAGTTTTAATTTTTAAATTGATTTGAACAAATGCTACCTGATAAATTTGTTTTATTTTAAACTGATGAGAACAGATGCTTCCAAATTTCTTTGATTTCAGATGTTGTTTGAAATTTGTTTTTTTTTAAATTGATAAGAAAAAATGCTAATTGATATTTGCTTTTAAACTAATAATAACAGATGTTATATTTGTGATTTGTTTTAAACTGATAACAACTGATGTTTTTTTTAAAATTAATTTTATTTAAAAATTTTGATAAGAACAGATGCTACTTTGGTACTTTGTTTTAAACTGATGAGCACAGATGCTATCGAAAAACTTGACTTGCTTTGTGTTGTTATTGATGTGTGATGAAAAGAAAATTTGGTTGATTTGTTGATGAATATTGCTGCATGCCTGTATTTAGGTGTAGTCATATGAATGCATGCCTGTAGACACACTTGTTCTAGTTATATTCATAACAGCCTTAAACTTTAGATAAGCATCAACAATTCTCTGATCTTTGTCTCTGCCTCAAACCCTTAAATGTGGACAAATACACTTGAATCTATTTATATACTTTGGTTTTGGACTGGTACTTGAGGTGTGTTATGAATATGGTTGTTTATTATGCCTGCAGTTTTGAATGTATATGCATACATTGATATGTATGTTTGCATATATGATAATATTGAGTCTGTTTCTTAAGTCACAGATTTAATTCAACCTAAACAAAATTAATATCTGTTCCTATTTTACAAGCCTCTGTTTAAAATCATATAATTATAAAACCACTTTAAAATTTTGATGCATTTCCTATGAATTCATGTTTAAACTGGACCATTTGTAATTGCTTTGTGTATACTGCTGTTGTAGTTAAGTTAAGCTATGCTTGATGATGTTTATGTTTCTTTTGTCCACTGTTCAGTTTCATTTATTTGTTACATTGTGCCTCACTGCCCTTGTACATAATCTGAGTTGCATGCTTACAGCTGCATGCTTGTTTGTTGCATTCATGTCTGTTTAGTTGAGTTGCAGTCTTGTTCAAAAGTTTATGCATACTTGTTCTTCATTTAGTCCACTGTATTTATTTTGGAACATGGCTATTTCATTTTGTGTCTGCATTCATAGATGCATCCACCTTTGCACTTGTTCATCATGTAGCTTGTTCTCAACATTCACTTGACTTGGTTTGAGTTTTCTTGCTTTGAATTTTTTTTAAGTGGCCACCACGGCTTGGAATTTTTTGACCTGTTCAACTTTGGCCATGTCCCTTGATTTCGACTTGGACTTGTTTTAGGGCTTTTGACTTGAATTTATTCTCGAACTTGCATGTTTTACTGAGTTGCTTCTTTGCCTTGAGTTACTTGGACATTTATTTGGGTCTGCACATTACTGTTTGTTGTTAGTCGAGTTGAGTTGTTTCTGTTGCGTTGTGAACTTTGGTGTTGGTTGCCGTTCTTGAATGCATATTTGATTTTGAGGCAGTTGCATGTATTTTGTGAAGGTCAGTTGTATTCCCTGTTTGCTTTAGAAATAACTATAGTTATATTCCAACTTTCTCTCCTCTTATTCCTTTTGAGATAAATTGAAAACAAGTTTAAAAACCTTGTCTTGAACCTGTACCATGTTTCAAAAATAAATCAAACTTGAGTTGTTCTTGAGTGTTATCTCTGGCCTTTGTAGTACTTGGTTGTTGTTGTTTGCATTTGGTTTCAGATTGCTATTTCTACTTGGATGTTGAGAACTTTGAGTTGTTTCATGCTTTTGAACTTGCTTAATTTTGCATTGCAACAGGTCAGATTTGCAGTTTGAAATTGTTATCACCCAGGAGATTCAATACACTCAATTCAACATGCATTCAATTTTTAAACAAATATTTCATATAACATCCTGATATTCATTCATAGTAGCAAGTTGAAACCAAGTTTAAACACTGTTTTAAAAATCTTAGTTTACTCACCTTTATTCAAAAGCAGAAGACAGAAACTATTCCAGGTTTTTCAAATTTCTTTCTACATGTTCTTGAACTTTAATCCGTATCTATCCTTGCATGTTGAAAGCAATTTTCTGCTTTTTGTGACTTGTGGTTGCCACTGTGTTATTTGAGTTGCCTGCAGTCTGATGCATTCATGTTTCTTGACTTTGAATGTTGCACCTGAGATATGTCACTGGACTTCACTGGACTTACTGATTTCGACTGTCCATGTGCGTGTCTGCTGCTGTTCCTTATCATTCCTGTACTTGTGTTACTCCCTGTTGTTGTAATCCTATGTGTTGTGTTTATTTTCAGTGGCCTTTAGTTTGAAATATGTTTGCAGTGATTGGTCTGACTCGTGCACATGTGTTGACGAGGCAGTGTACATGGGTATGAGTACACGTGTGTACTGCAGCCACACATGTGTATAAAAATTTGGAATCGTTAATGTGAAAATCTATAATAGACTTAAATTGATTTATCTGTTTCACCATAACTGTAACCATTTATTTCAGTTCATTTCAAATTTAATTACTTGAATAAAGATTAATCCTGACTCCGAGTGTTTTTGTGTTTTTGCATAAACGCTCGGGTCAGACCGAGTATTTTTTGCAGCTTAAAGATTTGCTCGCAGCGAAGTTAGAGAGAGGGGGATTTCAGCACCACTAAAGTTTAGCTAAAATTTTTTCTCTTGTACTTATAAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020258564.1	1.6e-25	LOW QUALITY PROTEIN: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34300
Swissprot	P17801.2	2.1e-09	Putative receptor protein kinase ZmPK1
trEMBL	A0A6I9RG12	2.5e-23	non-specific serine/threonine protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G34300.1	56.92	8e-13	69.7		lectin protein kinase family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g156316	AT5G24080.1	78	38	2	75	152	269	342	46.15	7e-13	69.7
g156316	AT1G34300.1	65	26	2	73	136	621	684	56.92	8e-13	69.7
g156316	AT5G35370.1	66	34	1	75	140	654	718	46.97	5e-12	67.0

Ortholog group

Species	Genes
-	-

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00069.22	Pkinase	Domain	65	136	41.8	7.2e-11

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network