result

Gene information

Detail information of g174267

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g174267	CHR4	132774891	132784870	+

Sequences

CDS

>g174267.t1
ATGGGCGTCGACCCGACCCAGTGGGTTCTTCTAGACGGGTCGGGTTTTGTCGGGTCCAAACTATACATTTTAAAATCTAGACTTGACCCCACTCGACGAGTCTGGTTAGGTTTTTATGGTATTTTCATCACCCATACTCGACCCGAGACCCATCGGGTTCGGTTAGGTTCGGTTGGGTTGGATTCGGTTAGGTTCAGGTTTGTGGTTCTCGGTTCTAGATTGTTTAAAGGCATTAGTTTTAGGAAACTTTTAAGCAAGATTTCAAAGGCTCTTTTTGAACAAATAAAAATAAAAATGGAAGCACAAACTCCACCTCAAAATCGACAAACCCTAGAAACAGCATCGTCTCTAAGTCCAAATCCAACTACGAAATCGACATCTATGAGCAGCCACGACGTAATAAACCAAATGCCCGACTTCCCTTCCCGAACCAACCCTCTCCACCGTCGCGCCCACTCTGAAATCATCTCCCTCCCAGACGACCTCGACTCCTTCGACGATCCCAGCGACTACCTCGCGGGACCCACCGACTACGACTATGGTTACAATGAAAACGATGATGACGATGTTCTAGCCATGTATCTCGACATGGACAAAATCAAGATCGGCGCCGGTGGTGAAGACAGTGGTGCTGTAAGTGGCAGTGGTGCTTCTTCTAGTAGTGGCAATGGTAGGGCTAGGCATCAGCATAGTCAGAGCATGGATGGATCGGAGATGCATATTGGGTCATCCAGTTCGGTAGTTGCGGATGCCAAGAAAGCAGCGATGACTGATGCTAAACTAGCTGATCTTGCTCTTGTTGATCCAAAACGTGCTAAGAGAATCTGGGCAAATAGGCAATCAGCTGCACGGTCAAAAGAAAGGAAGATGCGGTATATTGGCGAGCTTGAACGAAAGGTACAAACTCTGCAGGCAGAATCAACAACTTTGTCTGCTCAGTTGGCTATGTTGCAGAGAGATACGACAGGCCTGTCTGCTGATAATAGCGAGTTGAAGATGCGGGTTCAGACTATGGAGCAACAAGTTCACCTCCAAGATGCAATAAATGATGCACTAAGAGAAGAGGTTCAGCGACTGAAACTGGCAACCGGCCAGATGATGCAAAATGGACCGATGATGAATTTCGGACAATCTTCGTTCGGAACGAGCCAGCAATTCCATAACCAGCATCAGCACGGTCATAATAGAAACCAGAACCAGGGTATGCAGTCGCTTTTAACTGCACAGCAGCAGCAGCAGCAATTGCAAATGCGACAACAACAAATGCAGCAACAGCGCCAGCAAATGAGCAGGCGAACTCTCTCTCCTCAGAATTTGCGAGAGAATAACAACCACACTTCCCTTTGA

Protein

Gene

>g174267.t1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020248084.1	6.7e-48	probable transcription factor PosF21
Swissprot	Q69IL4.1	3.1e-37	Transcription factor RF2a
trEMBL	A0A8B9AF33	3.5e-46	transcription factor RF2a-like

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G06070.1	57.34	1e-73	274		Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g174267.t1
Allium fistulosum	AfisC4G03596
Allium sativum	Asa4G02804.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	270	320	36.0	4.9e-09

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
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GO:2001141	P	regulation of RNA biosynthetic process
GO:0140110

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network