result

Gene information

Detail information of g251789

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g251789	Scaffold_57574:HRSCAF_440660	108630	123071	-

Sequences

CDS

>g251789.t1
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Protein

Gene

>g251789.t1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020242667.1	2.2e-158	probable protein phosphatase 2C 57
Swissprot	Q69VD9.1	8.3e-142	Probable protein phosphatase 2C 57
trEMBL	A0A6V7QIP2	1.6e-150	protein-serine/threonine phosphatase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT2G25620.1	69.03	2e-140	495	AtDBP1;DBP1	DNA-binding protein phosphatase 1

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g251789.t1
Allium fistulosum	AfisC2G02101
Allium sativum	Asa5G01868.1
Arabidopsis thaliana	AT2G25620.1
Oryza sativa	LOC_Os06g39600.1; LOC_Os06g39600.2

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00481.18	PP2C	Family	73	324	232.6	5.2e-69

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K14803	PTC2_3; protein phosphatase PTC2/3	EC:3.1.3.16	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network