result

Gene information

Detail information of g366989

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g366989	Scaffold_72720:HRSCAF_455806	62088	73238	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g366989.t1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020267322.1	1.3e-24	transcription factor RF2b-like isoform X1
Swissprot	Q6S4P4.2	8.3e-24	Transcription factor RF2b
trEMBL	F2DZG5	2.1e-24	Predicted protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G06850.1	71.21	2e-50	194	AtbZIP52;bZIP52	basic leucine-zipper 52

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g366989	AT1G06850.1	132	38	0	2	133	129	260	71.21	2e-50	194
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g366989.t1
Allium fistulosum	AfisC3G01837
Allium sativum	Asa2G01565.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00170.18	bZIP_1	Family	23	81	36.5	3.5e-09

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0140110

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network