result

Gene information

Detail information of g375002

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g375002	CHR7	165161697	165174040	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g375002.t1
ATGCCCGTGTATGGTCCAGCCTACCGATATGGCACCAAACTACTATTCTCTTCCCTTGTAATTTACAATTTTAGAGACCAACCTAACCCTAACCAAACCCTAATTTCAATCCACGCAAAAGGAACACAGAAAAAGAGGGAAAAAAAAACAACCAAAGGTACATAACTTTATCAACAGAAAGTGGAGATCGAAGTTAAGGGAAAGGCAGTGGAGACGAAGCCAAATATAAGGAAAATGGGAGCTCCGAAGCAGAAATGGACGACAAAGGAAGAAGAAGCTCTTCGAGCTGGAGTCGTGAAACATGGAGCTGGAAAATGGCGAACCATCCAGAAAGATCCTGAATTCAGTCATTGTTTGTCTACTCGATCCAACATTGATCTCAAAGTTGGCACCTTTTCATTTTTTCATTCCAAAATTTAGTATGAGCAATGCTACATTTACATATCCACAGAATTTCGTGTACTGTCGAGGAATGGAAAATGTATTACTTGACCTGGATTGTAACATTTCCCCATGCTTTTGAAAAGTCTTACGTATTTATGCTCATTCAAGAAACGTCCCCATACTGAATATCCTCTGTTAATTATCACATATTATAGTAATTTTTGTTTATTTTTTTAGGATAAATGGAGGAATTTAAATGTAAGTTTCTGTGGTGGCTCGAGAGAAAAATCAAGGGCATCAAGAACAAAGACTCTTTCACCCCTTGCAGGATCTGTATTCCCTCGCGAGCTTGCTTCAGCCCCGTATCAAAATGATGGTTTCCACCGAGAAGAGAAAAACCAAGGAAATCAAGATCAAATGAAGAACCCTAATTCCACAAAGAGGAAAAGGAAAACTTCTGGGTCAGTGCCATACCTTACCTCCTTTTTCAAATACTGGATTTGATGTCCATATTTAATACATGATTATATATAGCGAAGTCATATATGATATGTTGATGAATGTCATAAGTTTGAGGTGTTCTGTAAAGTTAGTTGTTCAAAAAGTCTATCTTTGGCTCTCTTGATTATAACTTTGATAGACAACGAGCCATTTATAGGTGATACAAATTCTAGTCGACCATAATTTAGGCTTCATGGTGTACATACATTTGCACATTGTATACCATACAAGGGACATGTATATTTATTTGAATATAGTTTTTAAAAATTGTACAGGGTTTCAAGCTCGAACATGAGCATTGTTTTGTGAAGAATACTTTCAACCTGTTACGAAGTAGGTGAATTTTACATTCGTTTGTTTATGTACACTTGATCATCTGATGTCACAATATAATATGTAGTACGCACAGGGGCATCTCAAGGTATTTTTCGGCCCCGAAACAATTTTTATGTAAAAAAGAGTGTTATATACACACGAAATTTCTTTTCGAGATGTTAAGGTGGGTGTTGAATTCTGCCTTAATTAACGTTATAGAAAATAACAAGCAAAGAAATGTTCAGTTTTTGTTTAATAGAATTTCTATAACTAGAGCGTTCTAAAGCTATCTGAAACGGGGTTTAAATCATAAGATTTTAAGATTTCTGATAACAATATAACAACAAAATGTAATTTCACAACGGTCATATTCGGGCTCCAGTGTTATTTGACTTAGTATAACCATGACAAATTAGGTAACAAATGCAATGCTTCCGGACTTTTGAAAAATTATCTTCTTACTTTTAATGTTTTTTCCTAACTCGACTTTATATAATTAGTGCAAATTACGTAACAATGCTATACTTCTAGAACTTTGAAAAAAGAAAAAGAAAAAATCAACTTTCATTTTTTTTCCTAACTTGAATTTTATTTTTGTGATTCATAGTAAATATAAAGTCATATATTTGTGTGTGTACGCATATACATATATGTAGTACTATGTACTACTTGGTCACACAAATTTTGTATTTTCATGCATTTTGGACAAAGGATTATTCATCTTGACGTGGTTATACTTTATTTTGTTTTTATGGTTGATTGCTAGTTTTATATGAATCCCAATTAGGAATCATGTTTGAATAGTTCTATAAACATGTGGTATGTCGATTGAGATAAAGTTTTCTTTACATGCAAATTCACAAGCTCATACATGATCTCAACTGCACATGCATTGTTAATAGCCACTGCTTCACTTGATTGCAACAAAATGACAAATGTAGTTTTTATTTTAATGTTAGTACGTTAATTTTTAATTGTTCTGACGTTTTTGGCTTTGGTTTATCAAGCAGGTATTCTGCACTGATACTGGAAGCTCTCAACACATTAAAAGGGCCTAATAATTCTGAAGTCGAATATGGAGCAATTGTTAGTTTTATGAAGGTTATTTCTCATCATGCTCATTCATTTTACATTTGGAAACAGTTTATATGCTTGAAAATGTTTAGTTGTCATTTTAAGTGTCAAATTGTTCTTACACATCTTTCATGTTTAATTTTTTTAAACTTATCGTCTTTGCATATAATGTTTTTAAATTATCAACGAGGTTCTCAAAGGATATTGTTGGGGGAATGTTTGAATATGAGTTTTTAGTTTGTTGGATGCAATACAGTACAAAAATGAATTTTAAGATTTTATTACATGATTGAATGTATCCATTCATCCAATTTCCTAGTTTCGTGTTTTGGGAAACGAATTTATGTCATGCATGCCATCGGTTTTACAATGTTATGTGATATGTTATGTTTAATCTTGTGATGACACATGCACAAAAGAACAAAAAATTGTGGATTCTTTAGATTATCCAGTGACATGCCATGTTAGGAATTGAATAAATATTCTACTCATAATTATAAACATGGTTGCAATGTGGCAAGTTATGTTAACATCTATATGGTATATTCAAGGTTTTAAATCTCGGATATCGGACACGTTTCGTCTCGACGATTTTAGCAACTCGGTATCGTATCGGGGGAGATCTCGGACGCCGATATCGGATTTACATCTCGGACCTAAAGTTCATCTCGGGACCATATCGGAGTATAACACATCACATAATTTATAGGAAAAAATGTATGGTATTGGTTTATTTAACATTTACTGAATTACTGCAACTAACCTCCACTATTCTAACTGAAAAAATAATGCAACTATACCTCAACTATATGAAATTGTTCAACAAAAGTTACAAAACATCATCAGTTTTAGCAATTACATATAAGTAGATGAAAGACGACAAATTAACTAAAAAAGCGGGTTCTATACAGTTACATATATGCGGTAAGAATAACATAATAACAGTATCAGGAATTGATGCAAATAAAATCAAATGCATATAAGAGATATCAGGAATCGAAGGGTTTCAGGCAATGCAAATCTACTTGTAGAAGGTTATGCAGTAAGAATAACAAGCTAAATCTACTTGCACAGTTACTCTAAATTATACTGCATATTCAATTTTTGAAAGATTGAATTTCATTAAAATAGAAACAATTCTAATTTACATACATGTAGAGAGTAGAAAGATTAGTCGAAGATGAAGCTGCAGACTGTCAAAAGCGAGATCGAGTAGTCGAAAATTGAAAGGAACCGCGAGCTGTTGGATGTTGGAAGAGGGAGTTTGATTTTTTTTAAAAGAGGGAGTTCGATTTTTTCTCTAGAGAAGAGGAAGTTCGATATTTGACGAGGAACGTGATCTTTTGAGAAGTTGAATCAGAAAGAAAAGGGCTTTGTTTATTTTTCTTTATGATAGACTGAGATGGGTCTATTTTTTTGAAAAAAACAATATATCGGCGATATCTCGGAATATCGTTTCGCTTCAAATATCGGCCGATATATGTAAATTTCAGCCGATATAATAGAAATGAGATATCAACCGATATCTCATGTTTCGTTTCGCTCAAGCCTTCAACCGAGATTTCGGCCGAGATGGCCGAGATTTTAACCATTGTGTATATTGTGGATTGAAGAGTAAATGTTATCGGGCTTAGTTTCCAAGCCTAAAGTGTTGGTTGACAATGGTTGTAAACTGTAATTTACTCCACACACATAAGGGAGCTTCTAGATCCCAAGGGAGCTTCTAGATCCCAATGTAATCAGTCCTAAGTCATTTTGGGCCATGGACAATTCATATTTGGTCATTTCATACAATTCCAAACAAATAGCTTGAAACATGTATGTGTGTAGGGAGCGATCTAGATCCCCTCTTATTTATCGCCAAAAAAATCTGTATCGAAATGAAATTCTATAGATATGTTTATGTATTAACTAGATCATATATGTGAAGTTTGAATTCGTTTCGACGCTTCTACCCCCTTCAAAACTACATTCAGGATTGACCGTTAAAATAACTATTTTCGATTGTTCACATTAGCTTGTAGTTTCGAAGGTGATAGAAGTTTTGGAACGATTTCAAAATTTGCGTAGATGATATTGCTGATGTACATGATATATTTACGAGCATTTACTTGATCCGAAACTTTTTTGCACAATAAGGCGGAGGGAGAATAGAAAGTGATATTTGATGAAGGGTATCTTGATCATTTTCATGTGTGTATACGTGATATATATGTATGTCTAGGCACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTTCCGAGCCGAGATAGTTGTTTCATGATTATAGACAAAGCTTGAATAATTACCAAAAACGATGAAACGGTAATCAGACCAATAAAACCTTACTCATGAGCTATAATCCGTTCACGAAACAATCATCTCTCCTTATTTTTCCCCATTCATCTATCAGTTTAAACTTCAAATATCTGAAACAAGATTAACAAATACGAGCAAAGTGCGTTCCATAATAAATTGTCCGATAGTAGTGCAATTATAGTTAAATTAAACTTCTAATAAAATTGAGAAATCTTTTATTTAATTTTAATTTTAATTTTAAAAACAGTACTGGTTAGGGATAATTTAGTTGCAGTTAGTACTAAATTAAGTTAAAACAGTGAGATAAACAGTATCCGAATTAAAACAATAATTAAGTTAAAAAAACAGTTACTAACAATTGAGTTAAAACAATAACTTATTAACAAACAAAATTAAGAAAACTTATAATCTAT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020264146.1	3.2e-70	single myb histone 4-like
Swissprot	Q8W119.1	1.7e-44	Protein SINGLE MYB HISTONE4
trEMBL	A0A6I9QIT7	3.0e-62	single myb histone 4

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT1G72740.2	33.33	6e-33	138		Homeodomain-like/winged-helix DNA-binding family protein

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g375002	AT1G72740.2	282	174	4	67	340	1	276	33.33	6e-33	138
g375002	AT1G17520.1	314	149	9	67	341	1	292	33.12	1e-32	137
g375002	AT1G72740.1	288	174	5	67	340	1	282	32.64	4e-31	132

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g375002.t1
Allium fistulosum	AfisC7G01431; AfisC7G01432
Allium sativum	Asa0G03406.1; Asa2G03279.1; Asa3G03698.1; Asa3G03699.1; Asa4G01083.1; Asa7G02441.1; Asa8G01481.1
Arabidopsis thaliana	AT1G17520.1; AT1G72740.1; AT1G72740.2; AT3G49850.1; AT5G67580.1; AT5G67580.2
Oryza sativa	LOC_Os01g51154.1; LOC_Os01g51154.2; LOC_Os01g51154.3

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00249.28	Myb_DNA-binding	Domain	71	122	31.2	1.6e-07

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005515	F	protein binding
GO:0005622	C	intracellular
GO:0005575	C	cellular_component
GO:0000785	C	chromatin
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GO:0005623	C	cell
GO:0005634	C	nucleus
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GO:0042803	F	protein homodimerization activity
GO:0043047	F	single-stranded telomeric DNA binding
GO:0043226	C	organelle
GO:0043227	C	membrane-bounded organelle
GO:0043228	C	non-membrane-bounded organelle
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GO:0043565	F	sequence-specific DNA binding
GO:0044422	C	organelle part
GO:0044424	C	intracellular part
GO:0044427	C	chromosomal part
GO:0044428	C	nuclear part
GO:0044446	C	intracellular organelle part
GO:0044464	C	cell part
GO:0070013	C	intracellular organelle lumen
GO:0097159	F	organic cyclic compound binding
GO:0098847	F	sequence-specific single stranded DNA binding
GO:1901363	F	heterocyclic compound binding

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09422	MYBP; transcription factor MYB, plant	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network