result

Gene information

Detail information of g475539

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g475539	Scaffold_85058:HRSCAF_468144	336042	342666	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g475539.t1
ATGCAATATCCTTCGGTGTACTTGACGTTGGTACACGGAACAGGTACATTGATCAGTCCTACTCTTTTACCTAATTTTCGGGAAGAGCCGAAATATATAGCGCATTCCAATCAGGAGACCAGACGAGCACAGCATATCATAGTGTCTAAGCTATAAAGAACTTTTAAAAGGTAAGTGCTCCAATATAGTCTTTCCAGAACCCCAAAATAAATTTAGGGTTTCGAAGCAATAGCTTCGTCTCTTGTCATGCAAAGTTATTCTCCTCCGTTCAGTAATTTCTTGGTGCGCACAATGTTTAATGGTACATTGGATTCTTCTACACCTACGCCAAGAGAGTTGGTTTTCCGTTCGATTTTTATTTTCGGTTTGAATTTATTTTATTTGTTGATAAGTAGCGAAAGTCTGAGAAGTACGAGCTATTTTTTAAGAAAAAGAAAAAAAACTAAATTTTCGAATCTAATTTGGTTTATCGAAATAAGGTGGATTTCTTTTTTGCAGCGTTCTTATTCTTTTTAACTCTTCTGGATTTATATGCTTCCCATCATGAAATTATGTCGATATCAAGAATTTTACAGCAACCCCGGATGTTATTTGATCATTTTCACTTGTTTATCATTTTAAAGTTTTGATCTTTAAGATGGTTGTTAATCATTATTTAAACAAAAAACAGTATTAAAATATATTACAATTTGACGACAGAAGTATAGATAAAATAAAGTAATCTATTTAGACATGTGCGCTTCCATTCAAAATGTAAACTTTATGGATTTTCTGTATAAAACAAAATTGAGTTTTTATGTATAGATCGAAATGGCGGCCAATGGTTCTTTGGGAGGGGCGTCACTTTTCAAAAGCGAGGAGATAATGGAAATTTGTGAGCTTGAATTTGGTGAAAATTTTGTAGAAGTGAGGTGTGGCTGCACAAGTAAAAAATACGGTGATACCACAGGCAAGCTCAAGATTTTTGAGTCAGGCGATCTTGAGATTGAATGTGACTGTGGGTGCAGGGAAGGTTAGTTGATTCCTTGTTTCCACAATATTTATTTAAAGCATTATTTCTTTATACTTAGCAATGAACTTATAATTGTTTATTTCTATTCTTCTTGTATTTATGCAAGTTTGTCTTAATTCTTTTATGTTAAGAATGAATCAGGAGTGCATGACTAGTTTATACAAGCTATAATATCTCATATAGTTCATTGTTTTTTTAACCATTAATGTTTTGCAAATTTTGTATTTGTAAATTTAATCTATTATTTGTCAACATGCATGATTATATGTATTTGATTATCATTTTTTATTTATTTTTTTATTTTATTTTTAATAATTTTTTTTTTGCATGTTGATATGGATCATATCCTTATTATGTAATAAAGCTCTACTTTTCCCCTTTTGTATTTTTTTCTTCTTTGTGACAAGGACAAATTAAAGGTCACTATACTTTATACTCGCACTTAAGTTCAACTATAACTTTATGTAACTCCCAACATCAGTAAACAGTCCATCTTCCAACATAACCAGAATCCTAATATTTTTGAAATCATGGCTTGATTGTGTTTGGCCAGGGTACAATTATCAAACATCGCCATATAACAGCTAAGATGTGGCTCTTAGGACATACCTAAGCAGACCTAAAGCAAATGCCAAGTTATATACTTTTGAAGATATGTCTTTATATTAATGACTACTACATATGTGATATATAACGAATGGTGTAGTTATAGGAGATTAGTGCATGCACTATAAATCTCTTTTCTATCATTTAGTTCAATTTTTTTATCTGCCAGATATCTCGTAGCAACTATTGCATGCTCTTTGTGGATTAGCTTTCATTTATTATACATTGATATAACTTTGAGCAGATTATGTTGTTTGAACTCCAAAACTACCCTGCTCAATTATGCTCTGACATGCTCATCTATCAATATTTACAATGTGTAGCAACTAAAATTTTAATACTTTAGAGAAACCATCATCCATGGTTACAATACTGTTATGACATGTATATTTTATAGATATTTTAGGAACTATTACTAGGCACCAAATTGTACCCTTTAAGCTTTTAACAGTGTCCTTAAAATATGACTATAAATACATCTTAAGCAAATTGAACTTGAAGCGTTAAGATTTTTTTGTTCATGTTTATTTAATTTAACCTGTAAATTACATTGTTCATAAGCGAAATGTAATGTTTGATAATTCATTATATATGTGATTACAAAGCAATTTCTGTTTTCAGTCGGAAGTAGTTACAATATGTTGTTGTAAATGCTACGTACAGACCAACTTATCCATGTTCTTTCAACGTTAAAAAATCAATTGTTGTTCGTTTTCGACATATTTTCCTTTTTTTACTTTTAGCTCAGTATATCTGAGGACTTTGCTGAAATTCAAAAGTTCATACCTGCATATTCATTTACATACTTCTTGTTTTTATCTTTTACAAAATATTTACAACGCTAATACTAATATTCCATTTTCTCTGTTAGAATTTCTCTTCGAGATACTATTATATCTAGCTTCCAAATTTTATTTCAAAAGGAACCCATATTGCTGAAGAACCATCCATGTCATTAATTTTTGTTCAAAATTGAACCCATATTTCAAAAGAAACCCATGTTTTTATCTTTTACGAAGTATTTTATTTTTAAATTTGGCATGAATTAGGACCTAAGGTGCTTATAGATGATATACCTGATTAACTTTGTTTCATGTTTAGAAACATCATTTCCATTATATGTATATATATATATGATGATGATGATGATGATGATGCTACAACCCTTTATAGATATCAGTTGATTAGAACCTGAATTATAAGCTATTTACTTTCTATTACCTTTTATTTTGCTGCCAATTGACTGTCATTTATAATTGAACAGGCAAGTTAACTCCATCTGAATTTGAAACACATGCAATAGGAGAGGGAGTTCCAAAGAGATGGAAACAGAAAATTTGGGTACAGGTGAAAGGAAAGAAGGTTCCGATTAAAAATACAGCATTGTTGAAATATTACAATAAAGCTGAAGAAGCAAGTGGTTCAATCAGAGGTGCTCGTGCTCGGCGTGTTCATCGTGACGAGTTCAAGTATTGTATCAAGTGCAGTAAAGCCCGTAGATTTCGACTTCAGACGAAAGAAGAATGCCGTGTATATCATGATGCAGAGAGAAATGCTAACTGGAAATGCTCGGATTTTCCAGATGGCAGGTATCATCATTTCTTCTTCTTATTATAGCCTATAACTAGTCAGCTTAAGATGTGGAGGTGGTATTGAGTAATGACATGTTGATTACACTTTTTTCCTACATTCAAGTCTCTGTTTTCTGCTTGTTTCCCATTCAGGTCAATTTAAACTGTGTTTTCAATCTTGACTGTTTTTTGACCTGTTAGCTGTTGGTGTTTGCTGTTAGTTTTTCGTTCATAAAATGTTCTTACATCAATCGAGTTAGCAATTTGATAGCAGAGCTAACTTTGACAAAGCATGGCATAAAAAACACCCATTTCAATTTTTATAACACGTTAATTGGTTAGAACACGTCTGACTTTGGATCAAAAATCTTAAAACATTGGTTAGAAAATTTGCTATTGTGCATTTAAGTAATTTATTTGTAGCAGAAAGTTTGAAACTAATATACTCTGATTTTTTGATGTTTTAAAATATCACAACAATGTTTCAGCTATATTGCATGTTCTATAAGTAGATTCTGGATGTTCATGCAAATGTTGTGTGAACTGTGATGGTAATCTGTTATGAAATTCAGATGTTTACGTACACGTGCCTTGTGTGGTGGTTTGATAAACGTCAAAAGTTATTAGCCGGTAAAAAAACGAGCAGATATTTTTACCAAACATTAGCAGTTTTACTTGTCCAAAAATGCAAATACAATGTTTTAGACTAAAGATTGTTGCATGGTTTAAGAGTGCAAATATATGATCATATGAGCGATTGCTTTCATTTTTGGTTATCAATTTCCATTGTCAGCCAGAATCAACTGGCACTTCACAATGCACCAGTGGTGCAACTAAATTGCTAGTTCATTTAATTTAATTAAAATGAATTGATTCATGAATAATTTAGTAAAAAGTGGTGTCTAAACTTAATTATAAAGAGTTAAAGTTAAACGTTGTAGAGCCCGCAAATTGCTCGAGCAATTGAGCTGTTAATTTTTAAAACTCAATTGACATATCATTCAATTGGCAAGTTTGCTCCGTTAATCGGTTTGCCAAATTGCAGTTGATGCATTAGCAATTTATGTTAAAATTGGCAATTGCTTTGACAATCATGAGTGTAACTGCTCTAAACAAACAAGCATGCTTGTGTGGAAGCTAGAATTTTTCATGCTAATGTCTTAAACAAGAATATGCACACACATGGAAGTGAAGTATGCATCCTGTATGAGAAAAATAGGTACTTTCCTGGATCAGCTACTTGTATCCTTTTTATTATCAAATAATTTGGTACATGTAATGCACATACATTCAAAAACACATCACTGAGAAAACGGCAACAATCTGAATGGAGCATTATCATTCTGTCTTTTCGGAATAATCATGGAGTAAAGTACTTCGGCTTGTGCCATGTATATGCATATCTAAACATAGGCACTTAAACGGCATATGCCTAATGCGTATGAGTGACAAAATCACTTCTACGGGACTTCAATTGCATATTTAAACAAAATCACTTGGACAGATGTTTAATTGCATGTGGCCTAGTGCATATAAGGTAATAAAATATAGTGAGAATTAAAAATTAAACAATTTTGTGGATCGTAAGTGATCTTGATTAGAGGAATAGAAGTAGGGAAATAAGGTATTCAACATTTGGATGTTAAAACTGTAAATTTATAAACCAATCAATCAACGAACAAATTACAATTGTACATTTTTCATATAATGTCTTTAAACCAAACGCAAAAGTTCATGTAGCCGAGACATTAGATGCTCAAATGAAATCTTGGTTTCTTCATTAAAAAAAAATCTTGGTTTCTTTATAAGAA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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020269599.1	4.4e-75	LOW QUALITY PROTEIN: protein ULTRAPETALA 1-like
Swissprot	Q8GZA8.1	4.3e-67	Protein ULTRAPETALA 1
trEMBL	A0A6A2Y5W5	1.7e-73	Protein ULTRAPETALA 1

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G28190.1	50.66	1e-64	243	ULT;ULT1	Developmental regulator, ULTRAPETALA

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g475539	AT4G28190.1	227	108	3	80	303	11	236	50.66	1e-64	243
g475539	AT2G20825.1	227	107	3	79	303	6	226	49.34	4e-62	234
g475539	AT4G28190.2	258	107	4	80	303	11	267	44.96	6e-61	231

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g475539.t1
Allium fistulosum	AfisC4G05987
Allium sativum	Asa5G05016.1
Arabidopsis thaliana	AT2G20825.1; AT4G28190.1; AT4G28190.2
Oryza sativa	LOC_Os01g57240.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
-	-	-	-	-	-	-

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0005622	C	intracellular
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GO:0005829	C	cytosol
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GO:0043231	C	intracellular membrane-bounded organelle
GO:0008150	P	biological_process
GO:0009909	P	regulation of flower development
GO:0009910	P	negative regulation of flower development
GO:0043226	C	organelle
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GO:0043229	C	intracellular organelle
GO:0044424	C	intracellular part
GO:0044444	C	cytoplasmic part
GO:0044464	C	cell part
GO:0048519	P	negative regulation of biological process
GO:0048580	P	regulation of post-embryonic development
GO:0048581	P	negative regulation of post-embryonic development
GO:0048831	P	regulation of shoot system development
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GO:0050793	P	regulation of developmental process
GO:0051093	P	negative regulation of developmental process
GO:0051239	P	regulation of multicellular organismal process
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GO:2000241	P	regulation of reproductive process
GO:2000242	P	negative regulation of reproductive process

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network