result

Gene information

Detail information of g491709

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g491709	Scaffold_87155:HRSCAF_470241	279147	289067	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g491709.t1
ATGAAGTTAGGCTGGGACCTAACTAAGGGCTTGGCCCGTAACCTCACTTCTTGGAAATCCAAATCCGACCCGTCTTCAGGCTCCTACTCTCTTGCCATAGACCTCCGTGGCGCTCACGAATTGTCCCAGTTTGATGGTGCCGAACGGGTCTGGAGATCCGGAATGTGGAACGGGTTAGAATTTAGTGGGTTGCCCGATTTCAACTCCTACGGTGACTACAACTTAACATTTATAAACACCGCTTCAGAAATATCGTTAGACTACGAAATGACCAACCCCTCAACGCTTGCAAGATCGGTAATCACATACAATGGAACAACGAATAGGTATATATGGGTCGACAGTTCGGGTGCATGGAACTTAGTATGGTCTGGGCTTAGTGGTAGGTGTGATAAATTCAATGTATGTGGGGCGAATGCTAAGTGCAACCCGAGCACGTTGCCTCTGTGCGAGTGTTTTCATGGGTTTGGGCCGAAAAGGCCAGCGGACTGGGCTTTGAGGGATACAGATGAAGGGTGTGTACGTAAGACTGGGCTGGCCTGTAGGAATCGGACTGACCGGTTTTTCAAGATGGAGCATGTAGTGCTGCCTGATACTTTAAGTGCAACTATTGATGCAAGTATTATAAGCCTTGATGACTGTAGAGAGAGGTGTTTGAGGAACTGCTCTTGTACTGGGTTTGCGAATTCGGATGTGCGTTCTGGTGGAAGTGGTTGTGTTATATTTGTTTCTGATCTTAACGACGTTGTTGATCTTGGGAATGATGGTCAGGATTTCTATCTCAGGTTGGCTGCAGCTGATGTAGGTATGTGTATGTAATTTTTTCGGTTATAACCTTTACTAGACTCCAGTGCATGAATGTTATCCGTCTTCTAAAAGATGTTAAATTATTTTTCTATCTTGATCGCAAATGGACAAAATGAAACACTTTTTTGTCCATACAGATAAAGGTTGATGACGATTGATGAAGAGATGCAGCTGTTTGTGTTAAAACAGTCGTATGTGTCCGAAAATTATGAGTAGTGAGTTTCAATGGCCATATGTCCACTATTTCACCTTCTTGACCACTGGTTAGGCAAAGTATATTTGAGTGGGCATAATTTAATAATTATTCCATATTATGTACCAACATTTAATGTATCATCAATATCATCCACATATAATAATGTGGAATTAGACAAAGTAATGTGAAATGAAGGAAAATATTGAATTTTCTGTAGTCAATTTTAAAATAGTATTCTCTATTTTCATAGTAGTCGACTCACATTTCAAAACACATTATGCAGCTTCCTCCCTTTTAGTTGTTTTGTTTTTTGGTGTATTACTAGTACTTGATGCAATGTTCAAATTATTTTTGGTATCATTGACTTAGCAACGTACCTTTAAAAATATATTTTTTGTTAAAGTTAGCCCATGTTTAGGAATAAGTCTTCCTAGTTTATTGGTCAAGAAATAAATTAGTGGCTTAAGTATAGGAAGTAGTTAGTTATTTTATTTAAAAATCTTTGTGTACGTTCATTTTGTTCATCAAGTGAATAACAATGTAGTTTTCTTTGTGTTTGTGTTTCAATCTCTTGCCCTCTTCTCTATATAAAATTCTAACATGGTATCAGAGCCAGGTTAGGGAGGAAGGAAAAAAAAAAAACAAAACAAAAACGAACTACGCAAAATATCACAGACTCGAATAAAGTTCTCAATCCAAATTCACGATTCCTGAAAGAAACAAAAATTTCAATCCAAATTCGAATCAGGCGATGGAGGAGGTTGTTCGGATTTGGGCGATTGCGAATTTGGGAGATTCGATTCAGGTGTGAGGCGCTCGAAGTTGCAATTGAGGTGATCGATGTTCTTGCTGGAGATTGGTGGAGTTTTGCTTGAGGCGATTTGGGGATTTCAGGTAGTGATCCGAAGCGGGTTGATGGAGTTTGTTGGAGGCGTTTGTTGATATGGCAGTTGTTATTGTTTGATCGCAAGCAGGGGTGGTGATGATGGTTAGGTGATTGAAGTAGTGGAGCAGTTTGAGATGGTCGCAGGTGGTTCTGGTTGACAGTGGGTTTCTGATGAGGCGTTTGGATGTCGTTGATGTGGTTGACAGGAGGAAGTTAATGCTGGGTGTTGCAGTTTGTAATTGGAGTTGGAAGTGAAGGCTGTGGTTGTTGCACTTGAAGGCAGTGGGCACTTGAAGGCAGTGGGTATATGCTGTGCCAGAAGTAGCAAGATTGGCAGATGATGGCTTGCTGTCGAGTGCCTGTTGTCGAGGCTAGGCAGTTTGAATTGTGGAGTATTGTGATGGTGTAGATAGCGGTGAATGATAGTGTGTGATGGTAAAGTCTTGTGTGGTGGTGGCAAATGTGAGTGGGTTATGGTCTGTGAATGTGACAGCAATTGGATGAGGACTGCTGCAGGGAAGGTGTGAACTGATCGATGGCAGGCTGTAAGGAGTGGAGGATGCAAATAGTTTTGCGGTGATGTATAGGAAGGGTTCGCGGTGCTTTGGTGAAGGGTTGTCTGAAGCTTGTACAAGCAGCAAGGAGGAGGAAGATGGCAGAGGTTATGCGAAAGGTGTATGTTCAGAGGAGGTTTGGTTGAAACTGCAGAAGTGATGCAATATGCCAGTGAAGTGGTAATTCAGTATGTAATGGAAATGTAATGCCACAGGCGTTGAGAGTATTGGCAGAGTAGTGGTTAAAGGTGGTATTGAGACAGTGTGGAGATTGATGTGTTGGCTGTTAGTTTGGATGTGGTGGAGCTTGTCAGTGGAAGGCTGGAAATTGATAGGAGAAGCTGTATGCAGGAATGATGTAGGTTGGCAATGGTACGATGATCTTGCAAAAGTGGTTTGATGAAAGGTTGTATGCTGTGGATTTGGCTGATGTTTTGCAGCAGCACGACTGGGTTTGGTTGAGGTAGGAGATGAAGTGGAAGGTGATTTGTTGTAGGAGGTTGAATTATTGGGGAGTTTGGGATGCAACCATGCACTTGCAGTGATTTGATGGACTGGGTTGTCGGGTTTGCTGAGCAAAAGAAGGTGGTTGAAGCTAATGTGCTGATTGTATGGATGAAGTGCTGAATTTGAAGTTTGAGTGTATGAAAAGTGCACTATGAGATGTGGCAGTTGCAGTGAAGTGATGGGTGCATGTGGTATTAGAGTAGAAGATGAAGACGACGAGTGGTAGACCGTCAGTTATGGGGTTGGACATTTGTGGAGTGCTCAAGAGAGAACTGTTTGAAGAGCATGCCTACATGTGAAATAGGTTGAATGAGGAAGACTTGGTTTTATGTCATCCAACAAGTAAGGAAGAAGAGCCGCGGTTCTCACTTGTTGGGGAGATGACAGATACAGCAGTATCAGGGATGACCCGAATGGAGAGTCAGTGGATCCCTAAGAGGAAACAAAAGTATTTGTTGATGGTTAAAGTACCAATCAACGTAAAACAGTTGAGAATGTCCAACCAGATAGAGATGAGAGTTGTGACCGAGTTCGTGTATACAAGACGATGAAGAAATTGTGTTGTAAACTGAATATTAACACATTCAGTTTAAGGGAGGGTGTTAAAGTTAGCACATGTTTAGGAATAAGTCTTCCTAGTTTATTGGTCAAGAAATAAATTAGTGGCTTAAGTATAGAAGTAGTTAGTTATTTTATTTAAAAATCTTTGTACGTTCATTTTGTTCATCAAGTGAATAACAATGTAGTTTTCTTTGTGTTTGTGTTTCAATCTCTTGCCCTCTTCTCTATATAAAATTCTAACATTTTTAACCAAACAGCTGCCAGCATCAATGCATAATTTGTATGCTTTTCTTTTCTTACCCCCCCCCCCCCCCCACACACACACAAAACACACACAACCCCCTCTCTTCCTTTTTGTGTTTGATTTTGAGTTTTGAAATCTTCCAATTTCCAACTATTGTTAGCTGCACAACTCAGGCGGCCATTTTTTATTTCTTTAAATAATAATCAAACATCAATACAGACAGATACTTTCCATATTATGAAACCAGACGTGCATATATACATGCGATGTTTTAGACTGGCTCTCGGAACTGCATAATTTGTTATGATTTAAGATCCCGCTAACTGCAGAAATGTTCCTTCTAAGAATGATAGAATTAATCTCTTTATTTTAAGTTAGAAGCTACTATTCTTATTCAGTTATTTGCTTTCATCACTTTTACAGGTGTCCCTACAAATAAGTTCTTGTTATTCACTATATAATAATCTTCAACTGCAAAATGCATTTAATTCAAAAACATCGATACCTTAACAGGTCTGTCGCCAACACAAAGCAATTCTAACAAGAAAGAGAGTAGAATCATAGCAACAACAGTGAGCCTTGTTATCGGGACTTTATTGGTTGCCTGCATCATGTACTGCATATGCAGAAAGAAGAAAAGAATTAGAAAAGGTACATTCACACAGTGATCAGTTTTATATATCATATGATATGTCTCTTTAGATATAGAATTGATATATATCTGCAATTTCTTAAAATCATACGAGGGAAATTAATCTTTGTGATTCATGATAATGTGGATGAGAACATTAACATATGATATAGATCGATATAATGCAGAGAACTGCTATGAGGGAAGTAAAATGGAAGATGAAGATCTAGAGCTACCATTATATGATCTAGAGACAATGGTTGCTGCTACTGATAATTTTGCAGTTGCTAATAAACTTGGAGAAGGTGGATATGGTCCAGTGTACAAGGTAGGGTTACACATCCAATTACTTCTGTTTAATGAAGAACCCTTACTAGATCTATGTTCCATTTCCACAGGTACTGCTGGAACTCATTCGTATTTTTAATTACATTCCTGTCTCTTTAGATATAGAATTGATATATAGTTGCTAGTTACTACATCAAAATCAGAATGCAATATAAAAAAACCATTCATCCAATGGATTTTCTTCATTTTTTATTCTTTTTTATTTTTCAGAAAGGAGCACGCCCATTTTTACCGCTTTCGAATTTTTGCATCTCTTCAATATGCAT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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020256468.1	1.9e-208	receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-8
Swissprot	O81905.1	8.7e-134	S-domain-1 (SD1) receptor kinase 8
trEMBL	A0A5P1FCT7	5.7e-207	Receptor-like serine/threonine-protein kinase

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT4G21380.1	40.33	6e-137	484	ARK3;RK3	receptor kinase 3

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g491709	AT4G21380.1	657	304	9	1	578	167	814	40.33	6e-137	484
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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g140573.t1; g140630.t1; g183911.t1; g183912.t1; g184314.t1; g47269.t1; g491707.t1; g491709.t1
Allium fistulosum	AfisC3G04819; AfisC3G04821; AfisC3G04823; AfisC3G04827; AfisC3G04832; AfisC3G07037
Allium sativum	Asa0G02522.1; Asa2G03974.1; Asa2G04276.1; Asa2G07482.1
Arabidopsis thaliana	AT3G12000.1
Oryza sativa	LOC_Os04g54130.1; LOC_Os04g54140.1; LOC_Os04g54180.1; LOC_Os07g36544.1; LOC_Os12g15550.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00954.17	S_locus_glycop	Domain	51	108	30.3	4.4e-07
PF00954.17	S_locus_glycop	Domain	107	139	28.1	2.1e-06
PF08276.8	PAN_2	Domain	161	229	70.1	1.1e-19
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	332	418	60.9	1e-16
PF07714.14	Pkinase_Tyr	Domain	430	562	47.2	1.5e-12

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0016773	F	phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor
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GO:0140096

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
-	-	-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network