result

Gene information

Detail information of g506648

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g506648	CHR4	181776451	181788893	+

Sequences

CDS

Protein

>g506648.t1
MYRPRPLHSFFEKNINKECNPKLAIAMPKPSRSVKFYSEEKASENVSIGYVDEELTIEDEEELEAVAKTATEDDATEEDVAIATTDSDEEEEESKNPSNNEIGRREKIRLREMERLKRKKFKEILDSQNATIDADMNNKGKGRLNYLLKQTAIFAHFANGCQSTGKKRGRRDRYASKASEEEDEQYLKDEEDCPASTGGTRLLTQPSCIQGKMRDYQLAGLNWLIRLYENGINGILADEMGLGKTLQSISLLGYLHEFRGITGPHMVVAPKSTLGNWMNEIKRFCPVLHAVKLLGNREERQYIQENLLVPGKFDVCITSYEMAIREKSLLRRFSWRYIIIDEAHRIKNENSLLAKTMRLFSTNYRLLITGTPLQNNLHELWSLLNFLLPEIFGSAETFDEWFQISGENDQTEVVQQLHKVLRPFLLRRLKSDVEKGLPPKKETILKIGMSQLQKHYYRALLQKDVEVLNVGGERRQLANICMQLRKCCNHPYLFDGAEPGPPYTTGDHLIESAGKMVLLDKLLPKLKERDSRVLIFSQMTRMLDILEDYLTFRGYQYCRIDGSTGGDDRDASIESFNCPGSEKFVFLLSTRAGGLGINLATADTVILYDSDWNPQVDLQAQDRAHRIGQKKEVQVFRFCTEFAVDEKIIEKAYKKLALDALVIQQGRLSEQKTVNKEELLQMVRYGAEMVFSSTDSTITDEDIDRIIAKGEEATAELDAKMKKFTEDAIKFKMDDNAELYEFDNEKDQNIVEFKKLVTDNLAEPSRRDRKRNYSEAEYFKQAFRQGNPTKPKEPRIPRMPQLHDFQFFNTQRLNELYEKEVRCLMQAHQKNQSNDSVEGDESEENQFTAEEQEEKEKLLAEGFSTWLKKDFNAFVRACEKYGRKDIKSIASEMEGKEEVEVERYAKVFEERYKELNDYDRIIKNIERGEARLNRKDEIMKTIGKKMDRYKDPWFEMKIQYAQNKGKLYNEETDRFMLCMVHKLGYGNWDELKTAFRMSPLFRFNWFVKSRTSQELARRCDMLIRMIEKENQEYDEQKRLALKEKKLASESNSPTKRTMNGLESPSLKKRKQRSAN*

Gene

>g506648.t1
ATGTACCGACCTCGGCCCTTGCACTCTTTTTTTGAAAAAAACATAAATAAAGAGTGCAACCCTAAATTGGCGATAGCCATGCCAAAACCCTCTAGATCTGTTAAATTTTATTCGGAGGAAAAGGCGTCGGAGAACGTATCCATAGGATACGTTGACGAAGAGTTGACAATAGAAGACGAGGAGGAGCTTGAGGCAGTGGCCAAGACTGCGACGGAAGACGATGCTACTGAAGAAGACGTTGCCATTGCTACAACTGACAGCGACGAGGAGGAAGAGGAGGTAAGAAGGGCCAGTTTTTTTTATTTTTTTTATTTCTATGTTTGATGTTTGATGATTTGAGAAATCGTTGGGATTGTTTTAAAAGCAAGATTTAGTTTTGTTCGTTCTGTAGTTCATTAGATTTTTATAGATTGCTGGTGATATAGGACATTTTTTGTGTGTATTGTTGGAGGCTTTATTCAGGTTTCAAACAATACCTTCACTTCCAGCAGTGTCTAAAAACGTAAAAGTGAGGCAAACTCCTGTTTCTTTTCCTGTCCTCACGGATCAACAATGTCGATTTGAGTGTGGGGATGCGTAAAAATGGTAGTTTTTCCGTACTTTTTTGAGCGTGAATCTTTTAATGGTTCTCTGAAAATTGTTAAGGCCTTGTACGAATTTCAAAATTCCGTGTAGGACAAAAGGCTTTCTAAATTTTGTTTAAAAGCATAGATGACGTTATTTTGGCACTGTACACGATTTTTTGAAAAGAGTTTATAATAATTTTTAGAAAAAAGACCAGTTCCTCCTACTCATTTGCAGGAAGAGGGTATGCTTTGTGTGTCAAGTGTTATGTTATGTTTCCTTTTACGATTATCATGTAGTTTCATGTTGTGTTCTATGTTGTATGTTTTAGTTCATTTTACCGTTATCATATCAATTTTACTAGATCAAAATAAATATAAAAATATTTATTAGAAATGTCAAAATATGTTTAGTTGTAAACAAATGTATGAATACCTAGATAATGTGATACAAGTTTGGAAAAATGAAATAATACAATCTCATACATGCATCCTTACAACTTGATAAGGAGCGATTATGTTTTACATCTTCCTAATAATCAGTTTGCAATTCAAATGGCTCATTTTGGAAGGAATTGATTACATTATGCAATTCTAAAGTGTACAATAGCTCTTCAAGGAAGAGTATTGTTGAACTACCATTTGTATGAAACAAATGGAGAGAGTGTATACAGTTGAAAAAATTGACGATCAGCGTTGTTTCTTGTTTTGACAACAACTGCCTAAGTTAGAAATCCACTCTATAGTTTGATTTGGTCTTGATTTGTTACTCTTGCTTTTGGTTTTCTCTCTTGTTATTTCATTTTTCAGATTTTGCACGACAATTGAATTTTTTTGTTCATTTTTAATAGATTTTGTAAGTTTTTTCTTTGCAAAAGTTGTTAGATTTGCTTGAGTTTCAAATACTTTGGTATCCAATTACCCAAAATTTTGAAATTCGGACGAGTTTTTGCTACTGGATAACTGATAGCTTCTTTTTGGTAGTAAAATTCGAGATCTTAAGACCTGGAAAATAGCCATTGGGAGTATAATTTGGTATGATATTGGAAAAATTGACCACTTGGAATGATACACCACTTGGGATGCTCTTAGTCTTTTATCCTAGCAATTAATGTTGTAAGAATATTTGGCCTGTATTATCAATACTAACATGTTGGATAATGGAAAACACAAGATGTGTTTTATTTTGGAAAATAACTCCACTTGCCATTTTTTTGGTAATCCCTAATTTATTCCTGACATAATGTTTGTTTTTCTTCATCTCAAACTCAATTGTAAATACCAACTCATTCTTTCTCTCTCAAACCAAAATCACAAATTGAGTTCTTCACTAAGATTAAGGATAAATTTAACCATGAGTCCAGTAATGTGTCATACATTACTTTTATTTGAATTGTAACCTCAAATAAGTAGATTGATACTTTATGTCAGCATAGGTTGAATACTCTATCTTGATTGTGATTTTGATTTGGTTTTTGAGGGTTGATTCATAATCGAGGAGATTTAATTTCAATGGGATTCGGATCTAAAGATTTTTTACAACAATAACTTCAGAATTAGTTATGCAACTTTCAAAATTGCTAGTAAATTGCTTTCAAAATTCTGTAGTGACTAATTAATATTAAGTGTAGCAGTTGCCATTTTTATACGTAAGACAGTTATAAAACAATGCAGTGGAAATTTGAATTTTCTTTCAAGATGTTACTTCAATTCAGTAGTCACAGATTGAAACTGATTGCTTGTTGTTTTGAATCCCTTTTTGTGCATATTGGAGTATTCAATTTTGACCATTATTTTTCGCATACTGTAATTTGGACCATTCATTTGTGGCACATTTGTCGCATGAGTGCTACAAGCTAATAATATATGTTGTCAATTTTTGCCTTTCTATAAATTTCTTCTGAAGTTGACTGGCTGTGCATTTATTTTGTTGATGGGCACGTGTGCCTCTTTATATTCTGAGTTTTTGAAGTTTTAGTGATTTATAGAGTGACCAAAATGCCAATGTAATGTGCATTTTTAAACTTTTGACTGCCGACACTGAAATATTGATCAATTGGCCCTTGCAGAGTAAGAATCCGTCTAATAATGAAATTGGAAGACGTGAAAAGATCAGGCTTAGAGAAATGGAAAGGCTTAAAAGGAAAAAATTTAAAGAGATACTGGATTCCCAAAATGCTACCATTGATGCTGACATGGTTAGTAAAAATCAAGCGATCCTACTAGTAACTATGTTATAACTGCACATTTAGCTTTCTTACTGTTTGCATTATTCCTTTATATCCATCATATATTAATTATTTCTTATGTTGGATATATTCAGAACAACAAAGGCAAAGGTAGATTGAATTATCTACTTAAACAAACAGCGATTTTTGCCCACTTTGCAAATGGGTGCCAATCTACGGGAAAAAAGAGAGGAAGAAGGTATAACAAAATTTGAATGGAATGTGAACAAATGGTTACATATGCTTTTTTCAGTTGTATTATGATAACCTATTGGTTTCCTATGATGCATACATGATCATAAACCAAATTGTGCTCATGTGAAAATTCAGATTGTTATATGATTTGTAATTCCAGAAATTTTGTTCTCACAAGATTTTGTGTTTGTACTAATAGAATTGCTATGCTACTACATAGCCAAGTTTGCACCATACATTTTAGTGTTTTATACTGATTTTTGAACTATGTTTGAAGAGACCGTTATGCTTCCAAGGCATCAGAGGAAGAAGATGAGCAATACCTCAAGGATGAAGAAGATTGTCCAGCTAGCACTGGAGGAACACGCCTGTTGACACAACCATCTTGTATGTGTTACTTTGTAGTAATACTAGTAGCTGATTTGAAACTATATTTCCTACTTCACCTTTAACATAGCTTTGCACCAACTACCGTACTCGGTACCAAATGAGTCATGAAAGTATGACATGACAACTTTAAAGATGGATGTTATATGATAACTCCAAAGTATGATATGAATATTTCTATCTACTAAAGCATGGACTTAGACTTTGTATGATAATGATGCAACACTGACATAACAGTTACAAAGAATGGCAAACTCTAGTGCATGAGCTTCTCTGCTAAATTAGGGTCTTACATCTGGAGTCACACAGTTCCTTAGGAACATGTGACAAGTAGAAGAACATTTGTTTATCTATATAGTGATGTTAAGCCTCTGTCTCTGGATTCATGTACTCTGTTTTGATTCCTTTGTATCAACATTAAAAGCCCCGTCCACTTCTTAGCCAAACTGGCTTGCCGATTATCAGTTGGATTTTAGATTTAGGTTTTGATAGCTGTTCCTTTTGAGACAATAAAGATGTATATTTGTTGGATTTGAATCTTAACCAGTTGACAAATAAATATAATGATCAGATTTGGCAAGCTGCTCCATATATATTTAGTAGCTAAACACAATTATATCTGAATTTTGGTAGCCAAAAGCCTGAATACCAATACTTTTTACTGGTATCAATTAAAACGCAAAAAGGCATCAAATTGATGTTGAGTGAGTGAACCATGATCATGTTTGTGATTTATGTATTCAAGCTTACTACAATGATTCTAATATTTTAAATATTAATTAAGAAAAATGGTTGGGAAAGAATTTGCGAACATAAGATGTAAACCACCATTAATGATTGCTTTAATAACAGAAAACAATTCCACTAAATGACTGACTAATTTTGCATGGAAGTAAATCAGTAAAATATAGATGGCCAAATGCTGCCTTATCTTGTTTTGAAGTTTGGTTTTCTTGCGGAATATTTCTGTAATTGTTATGCGTTTGTTACAGGTATACAAGGGAAGATGAGAGACTATCAACTTGCTGGGTTAAATTGGTTGATAAGACTATATGAAAATGGTATTAATGGAATTCTTGCTGATGAGATGGTAAGTGCAGATTTATTAAGAGGTTTAATGCTCTAGCCCAATACTTTATTAAATGCTTGTTGGACTCTGTGTATGTTGGTTTACATCATATTTCATATACACATTACATATTTATCAAAAATAAAATAAAAAATTGCTTGAGTTAGGGTCTTGGGAAAACATTACAATCAATCTCCCTGCTGGGTTATTTGCATGAGTTTAGAGGTATTACTGGTCCTCACATGGTGGTTGCACCAAAATCCACACTTGGTAATTGGATGAATGAGATAAAACGCTTCTGTCCTGTTCTGCATGCTGTGAAGTTATTAGGAAACCGTGAAGAAAGGGTAAACACTAAATCTTCTTTACTGACTGGCTCAGCTGCATTCTGATGATGAATTAATTTTTGACACATTTCATTTGCAGCAATATATCCAGGAGAATTTGTTAGTCCCTGGGAAATTTGATGTATGCATTACTAGTTATGAAATGGCGATCAGAGAAAAGTCTTTACTTAGACGCTTCAGTTGGCGGTATATAATTATTGATGAAGCTCAC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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_003529588.1	0.0e+00	ISWI chromatin-remodeling complex ATPase CHR11
Swissprot	Q7G8Y3.2	0.0e+00	Sucrose nonfermenting protein 2 homolog
trEMBL	I1KN24	0.0e+00	ISWI chromatin-remodeling complex ATPase CHR11

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT3G06400.2	79.92	0.0	1580	CHR11	chromatin-remodeling protein 11

>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g151765.t1; g469405.t1; g506648.t1
Allium fistulosum	AfisC4G01324; AfisC6G06606; AfisC8G05878
Allium sativum	Asa1G00102.1; Asa4G01237.1; Asa8G00572.1
Arabidopsis thaliana	AT3G06400.1; AT3G06400.2; AT3G06400.3; AT5G18620.1; AT5G18620.2
Oryza sativa	ChrUn.fgenesh.mRNA.85; LOC_Os01g27040.1; LOC_Os05g05780.1

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
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Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K11654	SMARCA5, SNF2H, ISWI; SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5	EC:3.6.4.-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network