result

Gene information

Detail information of g526851

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g526851	Scaffold_91314:HRSCAF_474400	209790	224687	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g526851.t1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	PKA55018.1	5.7e-245	Beta-amylase 7
Swissprot	O80831.2	3.1e-224	Beta-amylase 4
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Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
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>>>Show top 3 blast result

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Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g526851.t1
Allium fistulosum	AfisC3G03000
Allium sativum	Asa2G02377.1
Arabidopsis thaliana	AT2G45880.1
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF05687.10	BES1_N	Family	53	168	125.1	2.6e-36
PF01373.14	Glyco_hydro_14	Domain	223	640	332.5	3.3e-99

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
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GO:0140110

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K01177	E3.2.1.2; beta-amylase	EC:3.2.1.2	Starch and sucrose metabolism	ko00500

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network