result

Gene information

Detail information of g80607

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g80607	Scaffold_35474:HRSCAF_359655	387324	395092	-

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g80607.t1
ATGGAAGAGTACAAAATAAGCCTTGGTTTAGCAATTGGAAACCAGGAAAACTGGTACCATGATAATAAGAACAAGTCTCATGTTCAACTTCATATGCTATTTCCTCCTAAAGCAAAAGAAGAAAATTACATTAAATCAGATGAATACCAGAGAAAAAGATTAAAGAGTTTTCCTTCAGATGATTACATAATGAAAGAAAGAGATGAAGATGGTGGCTCAAGAAAGAAGCTCAAGCTAAGTGAAGATCAAACCACTTTGCTTGAAGAAACTTTTCAAGATCACAACACTCTTAACACTGTAAGTTTTTATTTTATTTATTATTATTTTTTTTCCAGCATAGAAACAACAACGATCTTCACTATAAAAATAATTCATCAATGAGATCATGACTTATTTTTACAGATAGAGAAGCATGAGTTAGCAGATAAACTGAAGCTAAAGCCAAGGCAAGTCGAAGTTTGGTTTCAAAACAGAAGAGCCAGGTAAATATTACTGTATAATTTGTTTAATTAGCTAACTGTATTGAATGATGTGAGATTATTCATTTATTTATATTTTCTGTACGCTACAGGGATAAGCTGAAGCAGACAGAAAGGGAATTTCAGCAGCTAAAGAGGTGGTGCGAAACGCTCAGTGAGGAGAACCAAATGTTGAAGAAGGAACTTCATGAACTTACGCGCAAACAGATAGAACAGTAGACAAATTAATCTGTTTTTATTTTTATCTTGGGTCGGGTTAGAAGAAGTTGAGCACGTTTTTAAGTTAATGACACACTAATCTGATTTTACATTCCTGGTTATATGTTTTCCTTGGTAGTTTAGTCATCAACTTCTCTGATATATATAAACATTGTTAATAAATAGAAGCATCTATGATGCTGTTTAGTTTTTGCTCAATCAAACTGCTGCGCTTCATGTTGTCCTCTTTTTCTGATAATTTCTGATAAACAAGTGGAAAATGTGTTTCTTTTTCCAGCCATGTCCGGTAATTGCATCCATTTCTTGTAAGACTAATAGAGACGGTAATTACTAATTAAAGTGAAATGAACGCTGGATTAAATGGTTAATTAATATGCTGTTAAGGGTATTTAAATGCCTGGAAGTTATAACTGGCGTGCTTAATGATACTCCACTTCAATTTATTTCATAATTATTGAAACAAACAAAGAGATTTGGATCACCTGCAGAGTAGAGGCTCTTGATCTTTTTGTAAGAAATTGAACCTTGCATAATTTCTTTTTACGAAATTGTTGTATCTTTTATCATGAAAGTATTTCGTCCTCTTAATACATGCGATTAGTTTAATTTCATCTAACCATGGTAATGCAAAATTCTCTTTAATGGCTACTTTATCTATTCTCCGAAGGTCCTTTCGTTTCAAATTATTTAGAATCACTCATATTTTACAATTACCGTCGTATTTTAAGACATTCTTTTTCTTTCCACACGATCGTCAGTCAATTCTATTTTAGTATTAAGAAATAGAATGGTCATTATAAACAGGGTCAAATCAGAGGACTGTCTACCTAATCATAGGTTGGGCCAACCAACTGAACTTGGAAAACCTTCCGAAAATTTCTTTATGTAATTGTGTTCGGACTTATTTTTGAGACAAATTCCTTTGCCTTTTGATCAAATCACATTTATCCATTACTAAAAAATCAAAAAAAAAAAGTTGAGAAAAAAAAAAACAATATGATTTCACTTTGTTTTTGGTTCAATCATTCTATTGCATTACACGGCTCAGCTCAACTTCCTTAAGTACATACGGATTATTAAATTATTGACTTTGAGGATTTAATTAAGCCTTCGAATTAAAAGTTTGTACGATTTTGATCCGATCAAGAGCACTCTAAAATTTGAAGGTTGGTGATGCAATTTAATGGAGAGAAAAAATGAAGAAGCATTTTTCTGATGTCAAAAAATGAATTTGGCCTGGCATATTTATAGACGATGAAAATGTACATTCAAAATTCAACGGTTGTGTCCATTCTCTATAATTGTCATATTCGTTTATTCCAATAACTTTTAGTTTTAGTTTTAAAAATATGTCCGTTGAAGTTTTTCTGCCTAAACCCATTTGTTCAATTTTGAATATATTCAACATTCCTCCTATTTTCGAAACGATTTTAAATTAACAAATAAAAGGAACGACTGTATCACATAGGTGCTTGTCTACGTACCCAAGTAAGATCAAGCATTGGTTTTGTCCTTGATGTTGATGGATTCCAATGACGACTGCAGATCGAAGGCTGCTAAGTTAGTTGATGATTATCCTTGCCTTAGACAAAAGACTTTCCATCAATGATCGTCATGAATGCTCTTTATTATCCATTAATAGTTGATCAAGCAAGTTGTTGCACTAATTTGTTTCCATTAGATACTGCACTTGTTTTATTAAAAGCAAGTCCATGCGAGGTTTTCGATCATATTGATTGATCTTCAGTCTGGTTCGTTTTTGATGTGTTCGTGTTTGTTACGTTTGAGGATTCCAGGCTATCGCCCATGCTTCCATTTTGGCATTTGCATTTTCTTTATCATGTTTATACTAGGGGGAATTAATTTAAGTGGAAATTAGGAAGTCATCCCTGTCATACTTTCATATTGTAAAGCTGGTCCCTATCAAAGTTTCATTGTAAAGCGGGTCCGTGTTTTCTGAAAACGAAGAAAAATTATTGTTGAAATGTCAGCAACTTTTATAAATAAGTGCTGATATTTCAGCAACTTCAACTTTCATGCACTGTGTTTACAGCGTACATAAATGTCGCAGAAATGCCAGCAACTTTTATAAATAAGTGCTGATATTTCAGCAACTTTCATACACTATGTTTATACATGCGGAAATGTCAGCAACTTTTATGAAAAGTTGCTGAACTCCCTACAATAATCGTGAATAAAAAACAGGGACCTAATTTACACTGAAATTTAATGTAGGACTTTTCGTGAATTTTGAAACTTAATAAGGATCTGTGCCAAAAGTATCCTTAATTTAAAGGACAAAAATTCGTATATTTTTAGTCTCAAGGACACGACCTCAATATTTTAACCATAAGGAAAAACATTCTTCTGAAAATTATTCAAAAGGACAAACAATCTTTCAAAATTATTCATAAAAACATTCTTCCAAAACTGCTACCGAACTAAAAACTGATACCTAAAAACCGCTATCGATAACTACAAACTGATACCTAAAAATGCTATCAATAACTAAAAGCTGGTACCTAAAGAAAGTTGTTCTTCAGGCTAAAATACTGAATGTCTGTCCTTCAGGCTAAAATGCTGAAATTTTTTGTCATTTACAATAATTTACTGTTTATACTATTACGATACTTCCATAGATGTGTGGTCTCTATGATGTCATTATTCTAATTTAACACCTACACTAATATTACTACGATCATTTTATATTCCACTATGTTATGACTTACTTGACTCGTAACGACGCGTAATTTTATTACTTGATTTGGAATATTTAATTAATTTTAGATATTCGAATATAGATTTATTAAACATAAATTATCATGTTTTATGCGATAAATAATAATGGTGGTTTTGTTAAATAATAATGGTGGTTTTGTTTTGGAAAAATATTTACAAAAATATACTCTTTTAAAAATATCAATAATATGACCGAAAATCGTTTTATCGATAAACAGTTTTTTAACCATCAAAAGTCACGCACAATTTTTTTACATACAACTATTTCTCCATTTAAGCAAGATATTGTAATAAAATTATTTATTTTGTTTTTGAAATACAATGATGAAAGCTCATTTTAAATAATGATTTGAATTTAATGATTTAATGTTACTAATTATTAAAATCAAATGAGCCTTTTAATTAAAATAATCGTGAAATGATTTTTAAATTTTCTTTCATTTATGTGTAATTAATTAATAAGTGAATATGACCGATATCAGTGTCGATTTCAATGTTGAACATAAGTTGTGCAAGTATTCGCAACATTGTTTGTATTCTTTAGTACCTAATAAACATGCACTTACATGCTAAACATACATACACACACACATATATGTATACAAAATTAGTTAAATCAAAGATATAGAAAAAATAACTAAGATATTTTCACCAAAAAGCAAACAACAAATCCACTATTAATGCATGTCATTCCATGCTTAAGATATTTTTACAATATGTCTTTTCATATTACATTTCATTAATGCATGCACTTGAGTATGTTGGCAAGGATTTGATGTTGACGTAATGTGGTATAAGAGATATTTTTACAATATTTAAGTGTAGTTTAGTAATTTGCCACATTTTCCTAAGGCTATAAATAAGACCCTAAGGCTTCACAATCTACCACATCTCATTCCTTCTTCTTCTTCTTCACCTTTCCTTAAATGGCTTGCATCACCTCCATCTTCTCATCCATAAGCCGAGCTCTTCTTGAATTTAAATTGGAAGAAGAAGTGCTATAGTGATTGAAAGTGATAGCTTTAAGATAAGAAAAGTTTTACTCTTTTATTTAGTATTCCACGAAGCTATGATATGTTTTTATGCTTGTTTATTTATATGTTATCATGATGTTAATATGTTTGGATGGTTAATTAAGTATTTTGAAAGTTAATTAAGAAGTTAAATACTTAATAAGATATGTAGAAATGACTTGTACACATGCTTTGTCTATGAGATGCATGGAGACTTGAGTGAGGGGCGAACCATTTTGAAGGGAAAGCCTAAATGCTCCAAAATAAATATCAACAATATTTGTGTCAATCAAATAATTTGACCCCTCATGGGTGTTAGAATGGTAGTCTCTAGGCTAATGTTTGGGACCAGTTGCTCGCTCCTCCTAGCTATTTGGCTTAGCTCGACAGAGGGAAAAGTTAAATTGATTTACTCAAACCATTTTAACCCAAGATAAAACAGAAAGTGTTATAAATGTTTGATAGAATGAAGTGTTGATTATTATTTATTGTTATATTATATTCATTAATTGATTGTTTGAACTAAGCTCAGCCAGTATCTGAGCAAAATCCCTTTTTATATGCATGGGCAGGGTAGACAATAAATCGATGATGGTTTAATACAAACACCTTATGATTAGAATATAACAGTTTAACTATAAGGTGTTCGATGAGAATATTGGTTAAGCGGATTTTATAATAAAAGATTTTTATTATAATTTTGGAAATAAAAGATATTTATCTTTTGAATTGAAACGATTTCATTTAGAAAAGTAATAGAAATATTTTAAGAATAAATATTTTTGAAGGGATTATATATAAAAGTGATTTTCATAAAATGGTTTATAAAAGTGTTTTATAAACAAAGAGAATTTCGAGGACTAAAAACCCAGTGTTTGAAAATAATTTCAAAAGGTTTTGGGAAATGAAAATACTTTGATTGAAAGTAACTGTGAATGTTAGTGAAAATGATTTATCACTTTGGGATGTAAAATGATTTGTAATGTTACCGATGGTTCGAGTGACCCATAACTAAAAATTTAGGCAAGGGAGGTGCAGATATTCTATAGCCTCAGTATCCGCTCGACAAATAGAGGGATATACATATTATGTTTTTGAAAGGCCGGGACCTAGTTGTCTTGTTATGGCTGAAAACCTCCCGATCAGGTTGTATATATTTTTAGATGCTTTACATAGAGTATTTGATGCTTTTCAAAAGTGATATGTTTTAAAATCCCGAAGTAAAGTATAATTTGATATAAAAGATGTATATATTATTTCAAAGATTTGAATGAAAAATCGAAAGTTTGGTCCAAAGAAATTATTTTCGAAAATAAATATATTATGAAAATAATAAAGTTAATTGGATTTTTGAAATCTAAATGTGAGGATTAAACTAAGTGAACAGATTTGGAATCTACGTTTGCATTATAAATGCTATGTAGTTTGGGGTTTGCGTATTTGTTTGTGCATCGTAGGCTCCTATGGAGTCCTATTTGTGGAAGAAGAACTACGTTGGTTTCATCTTGTATCTAATTGGATATCCAGTTAGATAGGGGCACGTAGGCAGTCACAAGTAGTAGTGATGTAAAGGTGTGGATATATATAATATCAAAAAATTCACATAAGAAATTTCTAATTATAATATATATATATAGTGATTGGAAAGCATTGATTTAATTCAATGTAATAATTTTCAAAAGCTAGTTAAAGTTAAATTCTATATTTTAAAGCACTAAATATAAATATGTGTTTCAAATTACTATTTTTATATGTAGATTGCAAATATAACTTTAATTTGAAGTTCAATAATAATAATATCTTTAAAATAATTTAGATATGAAAATCCACATTTTAAACACTAGTATATATACTTAGTCATTGATTTAAAATGTTAATAATCTAAGCTTAAAACTAAAATTAAAATAAATATAAATGGGTTTTATCATATTAAGTAAACATAGTAAATAAAAAGAAAATATAAAAGATAAAAATTAAAAAATTAAAAAATAAATATAAAATATTTGCTTTAGGAATTGGTAAGCTAGTAAGAAGGCTCTGTGAACAAGTGTCAAAGTTATGAATTTCTTCATTTTAATACACTTTGGTATATATATTAAAGGGTCTTCTTCTCTTTCAACAAAACTAAAAAAAAGAGAAGATAAAAGGAAAAACCAAACTAAAATCTGAGGAAAACTAAATCAACCTCAAATTTTCAATCTGAAGCAAGAATCAAATTCGAGATTCAATTCAAGTTCAAATAAAAGCAAAGATAAAAGTTTATCTCAACTAAAAACAAAGTAGATCAGATCAAAGAAATCTATTTCCAGTTTTCAAATCCTAGTTCCTCTGTTCAAAATTTCAGTGAATAAATCTTATCTTTAAAAAGTTAAATCATCTTTATAGCTTGTGCATGTAACAAGTAATGATAGAAATGTTTCAAATAGATCTTGCATGGATGAAAAATGTGTTTTGCCTGGGTGTATAAGTTGATATTGCTCTGTGTAAAAATGTGCATATCACTGTTTGTTTTTAATCGACTCAGATAGCATTTAAAATTCAATTTCTTCTCACACAAACACATCTGGGTTATGATATCAAAAAGGAAGTGGTTTGTAATGATGAAACACAATCTTTAAAAATGATTCCAACTCTAGTTAGTGGGTAAATCTCTGGTAAGAAGGAATTCACAGTATAAATCAAAACATCTTAGAAACTCAACTTTTATAATCTTAAGAATTTCTTATATAACTAGGTTAGTCTTTAAAAGTGATGATTTTTTGGGGGTATTATCTCGATTTTTAGTTGTGAAATTGATGAGGTGGAAGGGGTTGATCGGAAATTGGTCATGGGTTAAATCTCGGCAAACCTCTTGATTTAGTGGTTCGCCGTTAGGCATGAAGAAGGGTGGGAAGTTGGTGCATCTGAGAAAAATGGTAAGAAAATTTTATATGGTGGGATGGAGTGCGGCGAGATTGTTTTAGGGTTTGTGGAGTGTTTCGTTGTCTTCTGTTCATGGCCGTACTGCAGCAAAGGAAGAGATAGAAGGGCCAGCGATCCTGGTGAAGATGGAAGAGGGTAGGATGGCGCACTTCCTGGTGAAGTTTGGGTGATGATCAACATTGGGTATGGTGGCAAACGAGGAAATTAGGTGAACGAAGTCTTCATTCCAGAGCAATGGAAGTTTGAAGTTCAATTTAGGGTTTTTGGCGGCGTTCCAAGTGGTGGAACAAAGGGAGGAGGTCAAGCGCGATTTGTGGGGGTAGTAGGTGATCAGAGTCGATGGACGGAGTTGGTGTACATATGCACGCGTTTGTGCATGTCCGATTCGGGTATCTGA

Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	KAF6161766.1	1.6e-28	hypothetical protein GIB67_013843
Swissprot	P46665.3	1.3e-22	Homeodomain-leucine zipper protein HAT14
trEMBL	A0A7J7N3T6	1.2e-28	Homeobox domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G06710.1	61.29	2e-27	119	HAT14	homeobox from Arabidopsis thaliana

>>>Show top 3 blast result

Query id	Subject id	alignment length	mis matches	gap openings	query start	query end	subject start	subject end	% identity	e-value	bit score
g80607	AT5G06710.1	93	36	0	68	160	183	275	61.29	2e-27	119
g80607	AT4G16780.1	94	33	1	68	160	121	214	63.83	4e-26	115
g80607	AT2G22800.1	101	42	1	68	167	105	205	57.43	8e-26	114

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g80607.t1
Allium fistulosum	AfisC4G04891
Allium sativum	Asa5G04096.1; Asa5G04097.1; Asa5G04181.1; Asa7G05806.1; Asa7G05807.1; Asa7G05808.1
Arabidopsis thaliana
Oryza sativa

Pfam domain

Pfam ID	Pfam name	type	alignment_start	alignment_end	bit_score	Evalue
PF00046.26	Homeobox	Domain	74	128	58.2	4.8e-16
PF02183.15	HALZ	Family	130	163	32.5	6.7e-08

Gene Ontology

Accession	Ontology	Name
GO:0003674	F	molecular_function
GO:0003700	F	transcription factor activity, sequence-specific DNA binding
GO:0006355	P	regulation of transcription, DNA-templated
GO:0008150	P	biological_process
GO:0009889	P	regulation of biosynthetic process
GO:0010468	P	regulation of gene expression
GO:0010556	P	regulation of macromolecule biosynthetic process
GO:0019219	P	regulation of nucleobase-containing compound metabolic process
GO:0019222	P	regulation of metabolic process
GO:0031323	P	regulation of cellular metabolic process
GO:0031326	P	regulation of cellular biosynthetic process
GO:0050789	P	regulation of biological process
GO:0050794	P	regulation of cellular process
GO:0051171	P	regulation of nitrogen compound metabolic process
GO:0051252	P	regulation of RNA metabolic process
GO:0060255	P	regulation of macromolecule metabolic process
GO:0065007	P	biological regulation
GO:0080090	P	regulation of primary metabolic process
GO:1903506	P	regulation of nucleic acid-templated transcription
GO:2000112	P	regulation of cellular macromolecule biosynthetic process
GO:2001141	P	regulation of RNA biosynthetic process
GO:0140110

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K09338	HD-ZIP; homeobox-leucine zipper protein	EC:-	-	-

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network