result

Gene information

Detail information of g8550

Location

Gene	Chr	Start	End	Strand
g8550	Scaffold_36279:HRSCAF_373601	90843	92164	+

Sequences

CDS

Protein

Gene

>g8550.t1
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Functional annotation

Database	accession number	e-value	annotation
nr	XP_020250050.1	1.7e-86	glutathione synthetase, chloroplastic
Swissprot	P46416.3	7.6e-79	Glutathione synthetase, chloroplastic
trEMBL	A0A7J7LRD6	2.3e-85	GSH_synthase domain-containing protein

Best hit in Arabidopsis

TAIR id	% identity	e-value	bit score	gene aliases	Short description
AT5G27380.1	59.14	3e-85	311	AtGSH2;GSH2;GSHB	glutathione synthetase 2

>>>Show top 3 blast result

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g8550	AT5G27380.1	257	104	1	51	307	43	298	59.14	3e-85	311

Ortholog group

Species	Genes
Allium cepa	g8550.t1; g8552.t1
Allium fistulosum	AfisC7G04267
Allium sativum	Asa3G01581.1
Arabidopsis thaliana	AT5G27380.1
Oryza sativa	LOC_Os11g42350.1; LOC_Os11g42350.2; LOC_Os11g42350.3; LOC_Os12g16200.1; LOC_Os12g34380.1

Pfam domain

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Gene Ontology

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GO:1901700	P	response to oxygen-containing compound

KEGG pathway

KO	Name	Enzyme ID	Pathway	Pathway ID
K03539	RPP1, RPP30; ribonuclease P/MRP protein subunit RPP1	EC:3.1.26.5	RNA transport	ko03013
K03539	RPP1, RPP30; ribonuclease P/MRP protein subunit RPP1	EC:3.1.26.5	Ribosome biogenesis in eukaryotes	ko03008
K21456	GSS; glutathione synthase	EC:6.3.2.3	Cysteine and methionine metabolism	ko00270
			Glutathione metabolism	ko00480
			Ferroptosis	ko04216

Expression pattern in different tissues

Expression pattern in BioProjects

Co-expression network