Gene detail

Detail information of GWHGAAEX001593/CADD00161.1.gene

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000110	917449	922599	-

Transcript Sequence
>GWHTAAEX001593 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AATTTCAACAACTTAGAATATCTTAATAAATAAAATAATTATTTTTATTATTATTTTAAAACTAAGAGCTTCAAATAAATATGGTTATATCTTTTAATGACCAACATGGAGCTCAAACTAAAAGATATTTTCTTAAATTTCCAAGCAAAAG

Network for GWHGAAEX001593

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation
Module4

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
--	--	--	--	--

Protein Sequence

>GWHPAAEX001593
VNITCTCLFIYKIACALISTRGVGVRSRLPRSLLVLLCCFFADFQLFFLYFFCYSCVFISSFFFHFFANQAFSSPASLRIKGGTSQSSLDKQRQRDQSRDIVSVALFMVGDSIVDSTTSSGDCRHSINLIVFYFFSYFSALNETHVMMFVFFTLNRAQMGTLNLSTDALILNLFISGLAVSSAFKALPYFFSSHDSMSKILAQHCKDILKAAVCSTYFDLWHVNLNFQDCTFVDYSVIIFYIFSKMLSQDAIFMCVKLAQDIWGIRCFAGVLNVDFCYKKFSLPRVGFLWLVIHPLHLCRFEATKLLNGAVLIIFDSVLNMHVVKVFMGDVLSILLEAQALEALVSSRFEFDSMICIYTGLSCKFELSLFEFDSIFSFMNNVRFKILGAVWFDVICYMILFKIVHKKVGVWFDVIVMTSQKLQKCHCIMLSECSSKINRHTDNITPIRRRDGRGRVLRARLGDSLPSLACHRRCRRRYQTHGRSQSPLAARDRCLLRCLRCLRRSLPSSLPCRARGAEGSLLPSPIAAFFVALPSQACGRFFAAFSLYAILTHFNCTSWKVYILISPFFFFLYFFTDKLIGMINIRILLIIFWMRFEFDSNNGGVKKKISFCHRTLPVLVLYRQLIEISNGVEFHVDVDACKWIVEAYGLNEFLRFCYSLCNYIIKEDLRTSFVRDAKGAFTYYCTYQVEIKISFVTNLLLHLSSNNDKLILVLSFRNNLSYNEELRLQIRNSVGKRIVLLKREICMSLFFTKVWMLLILIQILSQVIWYYEFDILCVNFGQTFFRSSVLSSNNLIKRFCYVYYQAYSFHLQFAMNLRKSSKFCSISKVINGRCCKCINYLRSKICFLLMEAAVNVFCCTQIMNGTICFIYCYLLFKHTKSLLSEYVIIICYLNNFLNNTESNNPLRIRVCVSNQNRKKILSYLLFGIVYISLVFLKYKIQFFLKITVNIEVRRKRFPFCWSLLKWSLLFLVFLLHFSSYSCNATWKSLCSFCYTFVYISICMGICEFFKRYQFVFFSKYMISKCLFIFYIFWITCLFDELLRTITVILLNYYFLNLVIDIDLDFLGKLVYVFLNGSRSFSCKCVIQFRFKFVFEHLHKLVESFLWLVYTLMLFIYPFVDKIGRSLLLRVILQVHLIHGSSSSMISTAISEHHIISNAIVTCSNSLAIVGMLCTPKNGSSQPSFVLHAMILRIIVPNIQLWLSSFNSNCEYNALDRPFFPCIFRRKFNYTLIHHLTSHFCCFQVFFIIFIVLSPYVLSIFFGQYSMFIIFLIYLFYSFKVSYGAFSLFLLLLESSLYRLWLLIYCYAFSLIHINKMSLHNDFSNIQWVGQFLLSKPSTGQRLKRSSYALSAQSLQSSVPPTCSKMKQNFDLKMSALDLWYGGHPMGQLWGFFMRMRRFLLLCNHLKRTYEANLRQQHGCLNKTLEIVNVCPSSFNKGHTRCRGFLKGLHNPIKEEAWPQFSALASPISKCFSALPACNLKRVAGFVIILMFFITSFCCGHYWDRQFSYNSGELLHASHNIKILYKTTYFKMILGALTSKKTDAFFCLRLNEGEISTTNILINKIIIFIIILKLRASNKYGYIFPTWSSNKIFSISKQK

Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	75.790
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	49.170
SRP108465	SRR5643513	five period of Gastrodia elata	31.640
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	SRR5643658	five period of Gastrodia elata	36.240
	SRR5643659	five period of Gastrodia elata	15.170
	SRR5643660	five period of Gastrodia elata	19.770
	SRR5643661	five period of Gastrodia elata	16.580
	SRR5643662	five period of Gastrodia elata	10.670
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SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	23.910
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	SRR6049658	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	20.170
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	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	15.010
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	23.630
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	23.630
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	19.67
	Juven	Juvenile tuber	29.06
	Mother_Gastro	Mother tuber of Gastrodia elata	49.94
	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	59.75