Gene detail

Detail information of GWHGAAEX004528/CADD00377.2.gene

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000019	2954670	2966439	-

Transcript Sequence
>GWHTAAEX004528 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TGCTGTGATGCTCTGGATCTGCATTACCTTTTCTTTTGCTGTGGAACTATGCATTCTGTTGAACAATTTTCATGGAACTATGCATTCTGTGGGGTTTTGCTTGCTGTGATGCTCTGGATCTGCATTACCTTTTCTTTTGCTGTGGAACTATGCATTCTGTTGAACAATTTTCATGGAACTATGCATTCTGTGGGGTTTTGCATGCTGTGGTGCTGTGTTCTGTGGGACTTTACTTGCTGTGGGTCTTTAAATTCTGTGATGCTGTGGGATTTTTCAAGGCTGCTTGCTATCTGTGATGGTTTTGTGACATTTATCATTGCTCCTGTTATTTTATGGTTTATTGTGGTCTCCTTTGGCTGTGGTGGATTGCTTCTGGAAGTGGTCTCTAATTGGGGCTGGTCTCTAATTGGGGCTGTCCACTTGCCTCCGATCCTCTGCTGGGACTGCAGCTTTGGCTCTTTCAATCTTTAATGGCTGATAGTTTTGGGAGGTGCTGCGGCATTCTTTGTTATGAGCAGGTTTGCACCTTGCAGGTTTATTCTTTGCTGGTTTCCCTCTGTGTTCTACTGTGGGCTGCTGTTATGGTTTCGTGGACCTGCTTGGTGTTTGTTGTGGGCTGTTGTTTGTCTCGTTTTGGTTTCGTGGACCTGCTTGGCTGTTGTTTGTTTCTCTCTCGTCGAGCTCGGGACTGTTTTGGGCTGTTGTTTGTTTCATGGACCTGCTTGGAGTTTAAAAATTGTTCTGCTTGGCTGTTGCTGGCGTTGTTTTGTCTCCTTGCAGGTCTTTTCTTTGCAGGTCTCCCTCTGTGGCAGGTTTACTCCTTGCCGTTTCGATCCTTCTGGGCGTTTGTTTGTTCTGCAGGTTTTCTCCTTGCAGCTTTGCTCCTTCTGGGCTGTTGTTTTGTTCCGCTGGGGGCTGCTGTTTGGATACGTAGACCTACTTGGCTGTTTGGTTGGTTCGGTTTGGCTTTGCTTGTAGGTTCGTGGTGCTTTGTTTCACCCTGGCTTTGCCGTTTTGTTTTGTTCTGCGCAGGTTCGGTCTTTTCAATAATCTCGATTGTTGTGTTCGTTTTTTT

Network for GWHGAAEX004528

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation
Module7

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
--	--	--	--	--

Protein Sequence

>GWHPAAEX004528
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Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	7.720
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	10.650
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SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	10.020
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	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	21.060
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	5.820
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	5.820
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	24.61
	Juven	Juvenile tuber	35.47
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	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	22.55