Gene detail

Detail information of GWHGAAEX007095/CADD00568.1.gene

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation
KOG	KOG0017	3.00E-12	FOG: Transposon-encoded proteins with TYA, reverse transcriptase, integrase domains in various combinations
nr	gi\|147818456\|emb\|CAN71978.1\|	1.19E-16	hypothetical protein VITISV_019883 [Vitis vinifera]
trEMBL	tr\|A5B3B1\|A5B3B1_VITVI	4.00E-17	Putative uncharacterized protein {ECO:0000313\|EMBL:CAN71978.1}
TAIR	AT3G31970	3.00E-12	transposable element gene

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000196	267478	276944	-

Transcript Sequence
>GWHTAAEX007095 TGATTGCCTGCAGTTCTTTTTTACGGGTAGAACATAAGATCTAAAGAATGCACCATCTGTCTGAGTTTATGAAGGTGCGTCCATGGAAAATGTAACCAAAGCATCTGGAAAAATAACAAATATTCTCGAACAAGTTAGGTGCTTGCATTAATTGCAATATTTCAGTTAGCCTTTTTTGTTGTGCATGTAGCATTTACATGCTTCTATTTTAGAGTTATTATTTCAATTGGTTTTATAAACTCAAATTATTTGTTCTCTATTTAGCCTATATTATTTTTTTAATCACATCTAACATCTTCCAGCTGCAATCTTTTTTCCTCGTAGTTTTCATTTTGGCATTGGTTTCCATTGTATGTATTATGATTGAGGATTAAGTTAAGACCACAAACTTGCAGTTCTGCATATTACGTTGTTGGATATAGAAGTTGAACCATTTTTTTTTCTTAAGCTTACATACCTTAATTTTTAGGATACTGCCAATAACTGTGAAGCTGTTGTCCTCTTAAAGTGATTGACCAGCTATGGCCTTTTCAAAATAAAATTGTTATACTGAGTTATTTCATTTTGTTATCGTTGCTAACTTCCCAAAATCTATTTTCTCAAGTTTCTATATACATTAACTACTCACATTTTGTAATGATCAGATCATTTGGACAAAGGGCGTTAAAATCCCCGCTGTCTAATTTCTGTTTATTACCCGCAAATTTTCACTTTTTGTTAAATTTCCTGCTAAAATTCGTTTTCGTCAAATTACTATTTATTTCTGTTACGCGCTAATTAAATAACTGATTGAGGAAATTTCTCAAAGCTAGTTATTGCTAAAATGAAATTTTAGCTTTGCCATTAATCTCAGATTTAATTGCAAATTAATAAAGCATTTCAAATTTTTTTACATTTACTGTAACCGATGGAACCACCTCTCCCACGCCATTCACGCATCCTCTAATTAGGGCTTACCGCACACAAACCCCCTTTCTGCACGCTAGAAACGCTCGCTGGAAACATACGCTGGAAACGTACCACTGATTAAATGCTGCTGCGTACGAGCATAGGTTCCATCCGCTTTTGAAACCGCTGAAATTAATTCAGCGGTTTCTAAAAAACCCTATTTAGGGCCGTCGAGCACTCTCGAGCAATTCACGAAAGCTGCGGAGCTCTAGGAAGACCCCACCTCTACAAACGACCCCTCTCCTCACCGATGGAATCGAAGGATACTAGCGGCGAGCACTTCCGTCCACTGTGTCACACAAGACGGACGACATCTGCTCCTTTCCCGCATGATCCTCTTCTGCACAAGACGAACGAAACCCTATTTGGACAAATTTGTGATCGCCTTTATTGACAATATTTTGATATATTCCAAGAATGAAAAGGATCATGAGATCCACCTGCCAACAGTCTTAGAAACCTTAAAGTATAATAAGTTATATGCAAAATTTTCTAAATGCCAGTTATAGTTGAACTCTGTGGCTTTCCTAGGCCATGTTGTAAGTACTGAGAGAATTCAAGTAGATCCAAAGAAAATCAGTTCCATTCAAGAATGGACTCAGCCTACAACAGTAACTAAAATCTGGAGTTTCTTAGAATGGTAGGTTATTATAGAAAATTTGTATAGGGATTCTTTCAAATTTCAAATATACTAGCTAAACTAATGCAAAAAGCTGTACCATTCATCTGGAGCTCTGAGTGTGACAATCGCTCCTATATAAACTTTACCACAATAAGGCGAGGATTACCAAGTATACACTGATGCATCCAAGTTAGGACTCAAATGCGTGTTAAAAACTAAAGGATGCTGCGACAATCGCTCCTATATAAACTTTACCACAATACGACGAGGATTTTACCAAGTATACACTGATGCATCCAAGTTAGGACTCGGATGCGTGTTAATGCAGAATCAGAAGGTAATTGCTTTTGCCTCTAAACAACTAAAAGTTTAGGAAAGGAACTATCTAGTTCACGACTTGGAGTTAGCAGCAATTGTTTTTGCACTCGAGATATGGAGGCATTATTTGTACGGGTAAAATGTGAAATATTCACAGATCATCAAAGCTTCAAGTACATTTTCACTCAAAGGGAGTTTAACTGTCGATAAAGGCAATGATTGGAACTCATTAGTGACTATGACCTGGATATTCAGTATCATCCAGGCAAGGCTAATGTTGTAGCTGACGCCTGAGCAGAAAATCGGTTAGCACACTTAGCATGATTATCATCAATGAACATCTGGTTAAGGAACTCAATAAGCTAGGAATAAATTTGGTAACAACGAAGCTGCTGAATGCCATTCTGGCTACAGAAACTACATAACTAATGTTAGAAAGGCGCATAAGACTGCCCCAAGAGAGATACGGAGTATCAAATTATGAAGCAGCTTATTTCAAAGGGAAAGAATAAAAATCTTCAAGAAAAGAACAATTACATTTATCATGGAACTCTATTAAGGGTATCTAAGGATAAAGAATTGCGAAGGGTGATATTAAAGGAAGCACATTGTTCAGGATATACTGTCTATCTTGGGAACTCCAAAATGTACCACGATTTAAAGAAAATTTATTGGTGATCAGGATTGAAGAAAGATGTAGGAGAGTTTGTGGTTCAGTGCAATGCATGCAATTTAGTGAAGGTAGAATATCAAAAGTCTGGAGGACTCTTCAATCTCTACCAGTCCTAGAATGGAAATTGATTGATATTGCCATGGATTTCATAGTGGGTTTACCCCGAAACAAATCAGGAGCAGATACCATATGGATCATTGTTGATAGACTCATAAAATCAGCAGATTTCCTCCCAATTAAATAGACTGATCCTGTGGAGAAGCTTGCTAGAACGTATATTAGAGAAATTATATGTAACAACCCAAATTGTTACTAAGGTGAATTGGGACTAACTAAGTCATGATTATGATTCTAGTACTTTAATTAAGTCATTAGGAGATCACTATTAAGACCTAGTTCAAATCAGGAGTCAAATGGATCAATCCTGATTTTTGGGAATTCCAGAAACTCTGGAAATTGACCTATTTAATTTGACCTCAAATCAAAAATCTGACTTCGCCATTGCGCTCATCACCCCCAAATTAGCTAGGGGTGAAGTTCTTGAGACATTTAGAAGTCGTTGGATTTTTGGCGAATATTTTAATATAATTTAAATACTCCGAGAATTCAAATAATAAATTCTCGTTAAAACAAAAATCCAACTTTGCCATTGCATTCTTCATCCTTCAATTAGCTAAGAGTGAATTATTGGAAATATTTGGAATACAATTAATTAGTTAAATTTAATTAAGAAAATTCTAATTAAATGATTAAATAATAATTATTATATTCTGCATTTAATGCCTCCGTCAGTTCCTATTGGCGCGCCGTCTCCTCCCTTACCGCGCCGTCGGATCTGACGACAATTGCTGACCGTTCGATCGGTCGATCGAATGGTCAGCATGTCTTCCCCATGCCTCCTGCGCACGCGTCGATTTGCCACCGATGGCGTTCGCCGCTCTTAGCACCTCAATAACTCCTAAACTGCTCTCTTCTCCTTCGATTTCACCGAAGGATTTCTTGGAGCCGTGCAGTGATCTTTGAAACCATTCGCGATTATCCCAAAACTTCTGGACCTTTCGTTCAAGGTACCTTGATCTCATTCAATTTCTATGTGATTGCTAATCTACTCTTTCGAAACATTATTTCACACCATGGATGGTTAATTTTCCAGTTTAATCAAGCTCAATTGAGCTTGATCAATCTAATTTGGCAAACTATATACAGTGGTATACAGTTTCGTCAGCTCGGTCCGTCGCTCATCGAGTCCTTTGTCCTAGGGTTAATGATTGCGGGTGATTTAGTTCACCTCATCTCCTGATCCAACCACCGATGGGCTGGTCTCGGCGACCTCTGTCTGTCGCCGTGCGGGCCTGAGCCTGATGTTGCCGGAAGGCCGCCCTAATTGGATGCCCTAGATTTTAGTCTTCGGAGCTCTGAAGGAGGTGCCGACGCATCTCGAGCCGTGGGGCCATGTGTCAGTTTCGCATTTGGTGGACCCCGCCTCGAGTCTTCTCTGCATGGTCAGCCCGTGGGGCCCGCCATTGATTGCCTGCTAATGTCGAGCCGTGGGGCCCACCGCTGTCCGAATCCTGCAGAAAAAATATTAATCAAAGTAAATCATTAAATTGGTTAAATCAATTTAGATAATTAAATGTTTAAATTAACTAAACTTAAATCACTCCTACTTTGCAATCCACTACTCCAAATATAATAAATATATATATTATTTTGATCAGTAAAATTAGAGGGTTAATTTGACATTATTAATTTTTCATTTGGAGCTGTAATTCATATAGTGACATTTAGGATCCCTATGATTTGACCTAAATTCTCAAAAGGTTCGATTAGCCATAACTTTGCCCTCACTCACCCAAACATATTCAATATGGGTCTTAAATTAATCAGCAAAACCTTAAGAATATTTTAGTAGTATTAATTTCTCTGTTTGAAATGTATATTGATTAATCACTTTTAAAACCAAATCCTAAACTTCCATAGCTCATAACTTTTCACACACTAATCCAAACATAGTCCATATGGGTTTTAAAATGATCAGGAAAACTCCTAGATTAATCTAATAGTATTTATTTCTTTGCTTGGGTTAGGATTTGCTTAATCACTTTTAAGACCTAACCCTACTTACCCTAATTAACCTTAGAACTTTAATTGACCATAATTTTGTCAATTAAACTCTAAACTAGGTCTTTCAATATATCATTTTGATCAAAAAGACTTAATAAGCAGTAATCTATAGAAATATTTAGGATTTAATGGCTGGATTTCTTAATAAACCCTAATCACCTTAAAACTTGATTAGTGAATATTAGCATAATTAATAATTCAAATAGAGTGATTCTAGTTTTGAATAGCTCATAGAGTAGAGTAGAACTTAAGTGTGGTTAGTTCTGTGATTCTGTGATTTATTTTATTAATCACTCACTAATCACCTAAAACTCTAATTAAGCCATAACTTAATCAAATAAGGTCTAATTTGGGTCTACTCCTAGTTAAAGTACTCAAGGGTTATAGGGAAGTTATAGCCACTGAATTTGTTGAATTTGAATTTCAATTAGAAAAGTTGGTTTTTTTTTACCCCATTTATCCCTAAATTATATTTTTTAAATCATAATCTCGTTTTGGCTATAACTTAGCCAATACATATCAGAATTCAATAATTTTAGGTTCTATGGAACCCTTAGACAGTAAACTTCAATAAACTGACAGAAAATTTAGATTTTATTAAGACAAATTACCAAATTACCCTTATGAGTCAAATTCTTTAATTTGGTCTCATAAGGCTTAATATATATCCAAATTTGATGTACTTATTGTCTATTTTCATCTTAGACAGTAAGTAATCATTTGTCATTTCAAATTTCCAAATTAGAGCCCTAAATCAAAAAAATTGAATTTTAGACCACCCTTAAGTAGGAGCAAAATGGTCATTTTGTCCAAACTTAGGTTTAAGTATTCTTAAACCTTAAAATCATATTATAACATCTAAAAACAGTGTTATAATTGATTTTGGATCAATTTAGGATGTTTAAGCTCATTAAAATTGTCAGTTTAAGGAAAACCTTAAAAACTCCTTAAAAATCTCGAAATCTTAAATTAAGCCTCATGAGGTGAATTTAGTTCACCTTATGCCTTCCTTAAGATAATTGTATCAGAATAATAGTTAAGTAAAGATTAAGATTTAAGTTTTAATCCTCTCTTTATCCCAAATCCATTTATTAGAAATTTTCTTTAAAACTTT

Network for GWHGAAEX007095

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation
Module12

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
--	--	--	--	--

Protein Sequence

>GWHPAAEX007095
LPAVLFYGNIRSKECTICLSLRCVHGKCNQSIWKNNKYSRTSVLALIAIFQLAFFVVHVAFTCFYFRVIISIGFINSNYLFSIPILFFSHLTSSSCNLFSSFSFWHWFPLYVLLRIKLRPQTCSSAYYVVGYRSTIFFSAYIPFLGYCQLSCCPLKVIDQLWPFQNKIVILSYFILLSLLTSQNLFSQVSIYINYSHFVMIRSFGQRALKSPLSNFCLLPANFHFLLNFLLKFVFVKLLFISVTRLNNLRKFLKASYCNEILALPLISDLIANSISNFFTFTVTDGTTSPTPFTHPLIRAYRTQTPFLHARNARWKHTLETYHLNAAAYEHRFHPLLKPLKLIQRFLKNPIGRRALSSNSRKLRSSRKTPPLQTTPLLTDGIEGYRRALPSTVSHKTDDICSFPASSSAQDERNPIWTNLSPLLTIFYIPRMKRIMRSTCQQSKPSIISYMQNFLNASYSTLWLSAMLVLREFKIQRKSVPFKNGLSLQQLKSGVSNGRLLKICIGILSNFKYTSTNAKSCTIHLELVQSLLYKLYHNKARITKYTLMHPSDSNACKLKDAATIAPITLPQYDEDFTKYTLMHPSDSDACCRIRRLLLPLNNKFRKGTIFTTWSQQLFLHSRYGGIICTGKMNIHRSSKLQVHFHSKGVLSIKAMIGTHLPGYSVSSRQGCCSRLSRKSVSTLSMIIINEHLVKELNKLGINLVTTKLLNAILATETTLMLERRIRLPQERYGVSNYEAAYFKGKEKSSRKEQLHLSWNSIKGIGRIAKGDIKGSTLFRIYCLSWELQNVPRFKENLLVIRIEERCRRVCGSVQCMQFSEGRISKVWRTLQSLPVLEWKLIDIAMDFIVGLPRNKSGADTIWIIVDRLIKSADFLPIKTDPVEKLARTYIREIICNNPNCYGELGLTKSLFYFNVIRRSLLRPSSNQESNGSILIFGNSRNSGNPIFDLKSKILRHCAHHPQISGSSDIKSLDFWRIFYNLNTPRIQIINSRNKNPTLPLHSSSFNLRVNYWKYLEYNLVKFNENSNMIKLLYSAFNASVSSYWRAVSSLTAPSDLTTIADRSIGRSNGQHVFPMPPAHASICHRWRSPLLAPQLLNCSLLLRFHRRISWSRAVIFETIRDYPKTSGPFVQGTLISFNFYVIANLLFRNIISHHGWLIFQFNQAQLSLINLIWQTIYSGIQFRQLGPSLIESFVLGLMIAGDLVHLISSNHRWAGLGDLCLSPCGPEPDVAGRPPLDALDFSLRSSEGGADASRAVGPCVSFAFGGPRLESSLHGQPVGPAIDCLLMSSRGAHRCPNPAEKILIKVNHIGINLDNMFKLTKLKSLLLCNPLLQIIYILFSVKLEGFDIINFSFGAVIHIVTFRIPMIPKFSKGSISHNFALTHPNIFNMGLKLISKTLRIFYFLCLKCILINHFNQILNFHSSLFTHSKHSPYGFNDQENSINLIVFISLLGLGFASLLRPNPTYPNPNFNPFCQLNSKLGLSIYHFDQKDLISSNLKYLGFNGWISTLITLKLDILALIIQIEFFIAHRVENLSVVSSVILFILLITHSPKTLIKPLNQIRSNLGLLLVKVLKGYREVIATEFVEFEFQLEKLVFFYPIYPIIFFKSSRFGYNLANTYQNSIILGSMEPLDSKLQTDRKFRFYDKLPNYPYESNSLIWSHKAYISKFDVLIVYFHLRQVIICHFKFPNSPKSKKLNFRPPLSRSKMVILSKLRFKYSTLKSYYNIKQCYNFWINLGCLSSLKLSVGKPKLLKNLEILNASGEFSSPYAFLKIIVSELSKDDLSFNPLFIPNPFIRNFLNF

Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	0.050
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	0.040
SRP108465	SRR5643513	five period of Gastrodia elata	2.890
	SRR5643514	five period of Gastrodia elata	4.720
	SRR5643515	five period of Gastrodia elata	5.540
	SRR5643524	five period of Gastrodia elata	6.810
	SRR5643525	five period of Gastrodia elata	3.590
	SRR5643528	five period of Gastrodia elata	36.160
	SRR5643658	five period of Gastrodia elata	2.980
	SRR5643659	five period of Gastrodia elata	1.690
	SRR5643660	five period of Gastrodia elata	2.190
	SRR5643661	five period of Gastrodia elata	1.550
	SRR5643662	five period of Gastrodia elata	1.010
	SRR5643663	five period of Gastrodia elata	1.270
	SRR5643664	five period of Gastrodia elata	1.570
SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	1.700
	SRR6049655	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	1.910
	SRR6049656	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	2.090
	SRR6049657	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	1.830
	SRR6049658	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	2.480
	SRR6049659	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	2.770
	SRR6049660	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	2.490
	SRR6049661	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	3.880
	SRR6049662	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	2.270
	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	2.790
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	3.410
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	3.410
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	4.26
	Juven	Juvenile tuber	4.69
	Mother_Gastro	Mother tuber of Gastrodia elata	37.43
	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	28.91