Gene detail

Detail information of GWHGAAEX008922/CADD00699.1.gene

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000025	5686594	5692803	+

Transcript Sequence
>GWHTAAEX008922 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Network for GWHGAAEX008922

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
--	--	--	--	--

Protein Sequence

>GWHPAAEX008922
LDYRWYLEGKERSHFQQSRHSSFYYLKHIQNHRHYLAENSLFYAEYWRHELMAYLFLLLADWFLLFSPAWNFPYWNLEICCFALIYFLIGGSRSGLAVCRMSAYGRSFSYYCWLYDFSFSSPGKRICHYGQALVLDILLLATILILLGVLRSFKSLNNWMFSLFGMLFLASSAFSLYEHFAVLDFVIWVFLTGGLFWLPWGMLLAGGFISVACSLKDKDGSFRPLLPVRLPILLILHWSLGLMPRQIFGLRTSLRRSILSLLFFFFFKCFSLSLSIFCLLLFCSILFFPDLFFSLFLLMPSLATFCMYSPFHFKIYGLRPQISKKKKRLCGCLYFKCLENVKIIDKKSIPLLSNGNQLDVVTYFSFVGHYSIMTCSTMGNKSPSNFFSVLFFFTGMLYFIRLSLNSGLSPYADSNALHICCFISSFLVNSSIVQMSLVLTVSHEMHIKRLDAKSYFKCYTFLLIENYLNTLAYQSLVKICSNQFSCKEGSWFTQALVYPKIYQIDALDMHNHYYNSSLPAFAFSCVLENKELETRNVNYYDKILFNFYTLYKVSISLNFFKFYFGPCNTIVILLSLSDKFLFLSPFASSFILIPIICCLTTTISLNPTTSTTILCFYCARSIRSPFTNVQIKLTVKKNNVIFLKNKNNLFLNVNINNNIVFNLLILIRFCTPIQFIYQLCQLNKFTNLLEIFVYRSWINIYSFKLSCQESTRSLLFVLSTQLGKIEFFLLDSHLRFLLYCIEKHKFLGFTILLNMAQVFDWEFYSILLKGTGYLIGSKTGTLSCFLVTKLLMCISCAHLLHTHTLVCKFMLRFINIYMILAVLMDDENIVFFYLYYTYYLFSNLTQIFMQNYYYAKERDSIRFTVLCTYSPKHCSQIGFVLVYPNRMLMMTTNYKTFNSSLFSPYYNHLILSALTSSITYFSAHLGACIHTPNPICDLIFLLQISTLFSLHYSLSYASLLIVCFFSLCLLSCKPQQLSLMVTTMLTCRILLTYSLFINGIFVLSSNAHAICSLFYLYRSCLAAAHTYVSIQSFIVILHISLYLGSSSFGCYLPSRHVCYHKALEYAVKASAFYPMSCKCRSILQSLRACSNIIGTSLASSIRIASTFAAFLYRRFLKVNKSPYQHSPFDLSRHWVMRIFCSTCVFTILQLFLAVIYYFDVLAFSMCSNYLGFKNSNNLFHILSLKTSLKILKNICNFSKNTWTDLVDTQERPWDDTREAKGRNHTRPFEAYPTQYWFSSTRSGCDNVASKCQLHNLFGSVSNIEDFQTSPIAIILHSTDSNFRRILHYYIVNENTGNRTNDVYDDFQMLTIYGWLSEYLLTIGYSKGLVSVRTSSVEYSKACLPSTDENVHVKQHHSNLAKHMPLVKKGLSYRRRNRPPPLTIASQMSMSGRIEARKQDGFTAALAYMKTQPGLRGLEREKPTNLWGQRSWASTMKDLLDGRALYGNRLHNLVTHMCMYFAIYIYINMFGLFYTSQVFQIKSVGEGIKYLISKVWYAFINGSTSLSFNFLSTFFLVFFWSSVHLVDVCGKLSFVFLIDSSFKSIDFPERGTSDDDDDSNNSIFPKILIVCCVLGCTSLKTNHFEFHTFFGNNFSYINKAIILFLHGNFCHLKARRNLFDIILLPHYVDKKLLNFAEHDLRCRDEEWSIVNKNNDKNLIPLSGIGCIKCCPHCALNVPKYHLYDHFFTYIQLEPSANYMDDRVFSEPKDDERGAIYLLLFFYHLLLYTVRWAFVYTAQINLFFLHYVQFVTVESEFDVVLASIRVRSRAQVQTQTFKRFGFELTRFFKGPGRIKPRAEVYGGRGAFATGLGKLLCKYQFFYFSHNCLIDRILCDLKKYATANVMMLIVNKNCLALQVMKFKIFIKVWLNFNMSQLCEGCQFYSKFVTRSSFESTTRLEIFKFILELNSLMNIVEFEFGTTIQLKSSYSKCIKKTCMFC

Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	7.790
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	6.420
SRP108465	SRR5643513	five period of Gastrodia elata	4.920
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SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	5.630
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	SRR6049662	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	2.720
	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	2.910
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	5.160
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	5.160
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	9.61
	Juven	Juvenile tuber	13.30
	Mother_Gastro	Mother tuber of Gastrodia elata	5.83
	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	8.31