Gene detail

Detail information of GWHGAAEX010286/evm.TU.scaffold_284.10

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation
KOG	KOG4441	6.00E-47	Proteins containing BTB/POZ and Kelch domains, involved in regulatory/signal transduction processes
nr	gi\|672116263\|ref\|XP_008781287.1\|	2.47E-57	PREDICTED: BTB/POZ domain-containing protein At2g30600 isoform X2 [Phoenix dactylifera]
Swissprot	tr\|Q8LEV3\|Y2060_ARATH	1.00E-46	BTB/POZ domain-containing protein At2g30600
trEMBL	tr\|M1AM73\|M1AM73_SOLTU	2.00E-57	Uncharacterized protein {ECO:0000313\|EnsemblPlants:PGSC0003DMT400025850}
TAIR	AT2G30600	6.00E-47	BTB/POZ domain-containing protein

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000278	394555	400160	+

Transcript Sequence
>GWHTAAEX010286 AGATATTTATCATCCGCTCACTTGGCACCCAATGCTGCTCACACCTCATTGGACAGGCTTTTTTGGGTTCAACGGGTGTGAGCAACATTCTTTTATTCACTGTTGTAAATGTTTTCAAGTTTTAAATTATTATTTTAAGTTTCTCCTACTTGATAAAAACTAATAGCTTTTGTTATTAGACTACTTAATGTGTTAGATGTCTTATGTTCAAAAGCTTATATTATTAGAAATAATCATTGAAAATTATGCTACAAATCTACCCGCATGCGTTGTATTTGATTTATCAAATTTATACTTTTTAACCCAAAATTTTTGGGGGTACATATGTAATACTTGTTTTCCCATGTCCACATATCTGTACGTTTGCCTAGCTTTTTAGATTTTTTTTTTATTAATTTTGCTTAGTCATGGGTATAGAAAAGATTTTTGAATAAATGGATTCATTGGTAGTTTCTTAAATGACATATTATATAGTTCTTAGTTTCTTAATTGATCCATCTATAATTAGCTTTGGATTTTTTTTTAATGACTAGTTTATGTAAAGTTTGGATGCACATGTGGATCTATATGATCTTTTTGTATGTACAATAGTTTGTTAGATCAAAGAATTGCTTTGAAAGATTTGCTTGCTTAGGCCATTAAACAAATACTTAAAGTTCATTAAACAAATCAGCACTCTATTTGATTCATTTAATATTTGATATAGGTTTGTTATATGAGCGCTCTTAGTTTGTTATATGAATGCTCTAGGTTCAATATACATTACAATAGCTATAGAACCGAGCATCAACTTGTAATTATTGATACTAAGTCTAGTTGGCATTGTGATTCAATTTTCAAAATGAAAGTAAATATGAGTGTTACAAAGCCATAAATTTCTTGCTTTACTTAAACTTTAATTTTAAAATATAATAATTCAGAGTAAACTTTATATGTAAATCAGAATGATGCTAGATGATTGATTTTCTAATAATGACATGCATTTCTCTAGTACAACAACTCTCTTCTCATATGAATATAATTGAACTAGTTGTCTTGTTTTTGTTTGAGCTTAACTTGTGAATTTTAGCCATTTTTGTGTTAAATTTGAGTACTAAGTGTAGTACAAATTATTGATATTTGTAGCATGTGAAGTGTTAAATGACATTTCTTAAAGTTGGAATAGTTTACTCAATTTATATCATTGTAAAAAATTATTTGGAATAGTTTGCACAATTAAAATGAATTCATTCTATAATATTTCAATGTAGTTTGATGTGTCTTACTTAAAATTTGAAGTTATTTATGCTTATGTTCATACCTAGGTCAAAGAGTAATATACCCTCTCTACTTTTATTTTACATAGTGATAAAGTGGATAGACCAATAATTAATGATTTTCTATTATTGCAATGCCATGTGTTCAAAAGTTGTATCCATTATAACATTCTATTAAATGTTTGAATTTATGATTCATATTATCCACAATTTCTTATTTTNAAAAAGTTCAATGTTGGCAATTTTTTAGTGTTAATAAGCTATATATATGATGTATATTTCTGTTATATCTTTGCAATATTTTCTTTTTAACAGATGGATGATTGGCATTGTTTGAGGATTAGTTATCTTATTTTCTCAAAGTGAAACACACAATGTCTAATGATAGGCATTGTTTGAGGATATGTTATTATCCATTAAGCTCATAATGTAATGTAGCAGACAATATTTTCTTATACTGCTTTAATAATTGCTGGTTAATTTAATTTAGTTACTCCCTTTCATTTCTCTATCAATCTAATAAATCTTGGTATAACTAATTTGATTCATCCTAGAAAAAAACATGTTGATTGTCGTCAATATGGTATCACTAAAAAGTCTTTAAGCTTTATGAACTAGTATAAAAAGTTATTAGGATCATGTGTCTCATAAAGATTAGAGGCATTTTTATAATCTCAAAACATAATCATCATGGCACCTCCCATCAATTTAATGTTCTTGCTTGTGAGTGGATGCAGCATAATCATTCAGATTAATCTATAGAAAAGAAGCTTTCTCCAAGGTGCATCTATGCATAACTTGTTTATGATGATAGCGAAAAGCTTTAATTATGCGCTAATTTTTGATTGTTTCATGGAGAATGAGAATGACTTGTGCTAAGTGCAATAATTGCAATGTGGTTCATCACATTAGGCCCAACATGAGCACGCAAAACTCCATAATATGCTAAGTAGATGATACACAAATAATAAAAAAAGTGAAAACATTCTTAAATTCTAGTAATTACAAAGGAGGATCTCACTATAATACATCAAAATATCTCAATGCAACCAACTTTAAGAGCAAAAGGGTAAATTAGAAGCTCACTACAAGGTAATAAAAAGTAATAGCTCAAGATAAACAACAATCATTTGCCTTCAAATAATTTACCCTTTTCATCTGCATTACTTGCACGTGCAACATTTCCACAATTTGGTGAGTAGAGCCATTGTCACAACTTTTCTAGTTTTTTTGGGGGATGAAAGCTATAACTAGCTGATTGAGACCTAGACAAGTAGTCGAGTTGACATATCATTCAAGTAATTGAGCAATCTTATGTACGGAGAAATTGCTGAGTCATCCATAAGACCTATACAAGTCGATTGGTTACCACTAGAAAATTTAAATTTGCTAGAAACAACAACATGAGGAGACAAGGAGGCAAAAGGCACCACATGGACCTGTGGCAGATCAACCACATGGAATGTTCCTCTAGAAAATTGGTAGACATTGTACAATATGATTGGATTGTAGGATACGGTGTCCTTGTTGGTCGGCCAAGTCGGTAGGCACGTGGGAATAATTTGTTTTTGTCTATCTTTACTATGAGTGTATGGTTATAAATACCTAAAAAACTAAGTGGTGATGCTTTTTCAAGTAAAGAACTATGCTAATTTACTTTTGAATTAACTTATTTTCATTTAGCATTAGTGAGCTATATAATGATGTTGCCTAAATAAGGTGAAGATTAAATTTGAACCTAATTGACCTACCCTATATAATGTTATTATATACCTTCGTTAAATTTAATTGTATTATTTTAGTGAAGATTAAGTACTTAATCTCGATTAACATATCCAAGGAAATCAAATCAAAATATACTTATCCTAAATTTGTGTTTAAATAATATGAATATAATATAAGCTTTAAATTAACATATTACTTAAGTAGTTATAGAAATTTAACTGATACGTAGTTCTAGGTTAGCCAAATTAAGTTGGCATTGGTTAGTGAGCATAATCAATGAGTTACCATTTGAACCGTTTGAACCATTTAAACAAACAAAAATTAGCCCTAGGTATTTAGATTAAAGGTTACCTATATTATTGCTTAATATTGGCTAACTACTTTAATATTCCAAGCACTTGGTCTACAAAGTGTTATTTGCTTTGATTTTCTAAATTGTTTATTGGTTTAATTGCTAGATGCATTAATAACTTCTGGTTTGGTAGATATTTCTTTGAATTAAATCTATAAATAAGACTCATTGGGGTAAACCTATCTCTTTAACCATTTTAATTATCACTTAAGTCACATTAGGTGGGAGAAAAATTGTACTTTTGATTGGCTTGTACATGCTGTTATTCGGAATGATGTACCATTTAAGATGATACTTATTTACCCAATCAACTTTAAGCTCTTTGTAAGCTAGATACTTACCAACTTCCTTAATTTTTATTTTGAGTAGATTTCTTAATGGTCTTTTAAGACACTTCTGGTGACCTGGTGTGCTGAATTGTTTAGCAATTTTCATCTGTTATGCTTGTTCTTTGGGATTTGATATGGGCCACTATTTGTAATTTATTGGAGTTAGTTTGATTCTATTTGTAAGCAATCACTTTTTATTTTTCTGGTTCAGTTGAGCCTGACTAGTTCAAGTCTTTTTATTTATAAATTTTACTTCAATACATTTTGAACCCTTCGCTAACAATTGGATGGTTATCAGCTTACTTTGTTTGTTTTATCATATGTTATTCATGTGCCAAGCTACTTTTGGAAAAACATTCTAAACTTGTGTTTTTGCATATCTAATACATTTTGATGCTTGCAAAACTTTTATATGGCCTTTTTTATATGAAATTTCATCAGCTTGCAATGATTGTAGGAGCTCAGTGGGGTGATTGCTTTTGCATTATTAGAATTTGGATGATATTTTTGTCAATATTAAATTTGGGTGATTGATATGTAAAAATATCAAAATTTTAAGTTGGATTTCACTTTTATTAATGTTGCAGAAATGCATTCAATTCTTGTGATTTTACAGAGATACATAATACTCTGTCACTCTATATTACATAGTAATTGCAATAATTGAATGGACTATAGAGTTACCTTCTCTCTCTTCTCTCTACTGGTTCGTCTTCTTTCCTCTTTAGGCTTTAGCTCGGAAAATGAAGTTGAAGACAAATACTTTCTGCTGCATTACTATATTTCTTTGGTATCATTATATGAAAGCTAACTTGTTTTGAAGATTTTACTTTTTTCAAGGAGTTACTATATGTGTATAAATTCTTCAACGATAGGCAGCATTACTAACGATGAATTTAATTTTCCTAATAATCTTTAATTTGTCAAATCACAATATTAGAGAAATAAAGAAATATATGCACGTTTAAGGCTAGATGACATAAATAAGCCAATAGGTGGTTTTGCAAGTTATGATTCTATTGATGTAAAAAAGTTTAGATAAACATTGTAACATTATAAATCATGTGTGCATCCTATAACTGAAAAATTGGTAATTTGATTATGCACTTTTTGATTAATCACTACTAACTTTCGAGGCACAATTAAAAAACTTCAAGCTAATTAAATATTGTTTTTTTTGTGCACATGCATTCTTGTTATCCTAAAACATGTTTTTGCAAATTTTAAATTCAAATTTACCGTGTTTCTGGTTTCTTTAGGTATGTGATAAATACTAAACTTAATCTTTAATTGAAACTCTATTTTCTGTAGCTAAGGCATAGTCCTGGATCTTTAAAT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Network for GWHGAAEX010286

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
PF12248.7	Methyltransf_FA	51	110	2.20E-10

Protein Sequence

Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	0.170
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	0.240
SRP108465	SRR5643513	five period of Gastrodia elata	0.150
	SRR5643514	five period of Gastrodia elata	0.470
	SRR5643515	five period of Gastrodia elata	0.410
	SRR5643524	five period of Gastrodia elata	0.430
	SRR5643525	five period of Gastrodia elata	0.140
	SRR5643528	five period of Gastrodia elata	0.040
	SRR5643658	five period of Gastrodia elata	0.140
	SRR5643659	five period of Gastrodia elata	0.320
	SRR5643660	five period of Gastrodia elata	0.460
	SRR5643661	five period of Gastrodia elata	0.310
	SRR5643662	five period of Gastrodia elata	0.160
	SRR5643663	five period of Gastrodia elata	0.270
	SRR5643664	five period of Gastrodia elata	0.250
SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	0.460
	SRR6049655	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	0.270
	SRR6049656	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	0.250
	SRR6049657	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	0.520
	SRR6049658	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	0.090
	SRR6049659	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	0.140
	SRR6049660	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	0.330
	SRR6049661	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	0.120
	SRR6049662	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	0.230
	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	0.010
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	0.250
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	0.250
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	0.36
	Juven	Juvenile tuber	1.13
	Mother_Gastro	Mother tuber of Gastrodia elata	0.25
	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	3.12