Gene detail

Detail information of GWHGAAEX011161/CADD00912.1.gene

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000350	31808	36780	+

Transcript Sequence
>GWHTAAEX011161 CTTTTGTATACTCATCTATCATCATTGTTATTTTCAACAATTATGTTTTTGCACAACTACTTTGGTGTATTATGTTGTTTACATTTGTAATTGTTGTGCAATGTATATTTGTTGTTAATCAAAATATCAAATACCCTTAATACTTATATCCTTGAAATGTTTGATGATCTTAGCTATATAGCACATATTGAGTTTAGATTATTAGTATACTACTTGCACAAGAGATTTGATAAGTCACACTGTAGGTCCAAGTTCTAAATATTTTTTTTGAACACCCATTTAATTGAGATTCACTATTATACCACCATCATTGCATATAGATGACATCTACATACCACTCTATTTGTTGGTACAATTGTTACACTAGAAGAATGACATGAAAATCTTAATACACTTCCACTTTAACAAGTTGAGCATCATAATCCACTTCCACATGCACAAAAAATGAATAGAGAGAATACACTAAACCATTGAGAGGATGTATTGCATGCCTCTTGTTTAAATATGAAAATAGATACTCTAAAGTTTGATGAAACTTATGTTCCTAATAAATTCCTGATTGCATTTAATAGTTAGATGCTATTTTTGAGTAGTATCACATAGATGGTTATGATATGAATTTCAATCCTTAAATGAAGTTATTAGTCTTGCACACTTTTATTAGACCAACAATCTAGCAAAAAAACAATGTTAGGGTTGGCAACTTATTACTTGGGTTGAGATTAGCACAACTGTTCAGGAGAAATATTTTCCACATCATATTTAGTTGCTTCACGAGCTACTTGTTATCTTTAAGATAGTACATATTTTTAGTATTCGTAGTTGAACACTTTTTAAACTGTGTAGTTCTATACATTGTATTAATTTGATTGGTATTTAGCAATAATTTTGTTATTAGGCTTGAAGCCAAACTAGATATGATGTAATGATGAATGATCCTTTAGATGAAGTGCTTCATCATTCTCATCCAGTTGACAAGTATAATAACTATCTCATACACACTTTTTTATTTCACTCTTCTTATTACTATGAATCCTCATCCAACCCTAATGGCTATCATTCTACCTTTAGGAGTTCCACTACCTTGGACCTATCTTATGCCCCTTTATAAGAAGTTTATGAAGCCCTCTATTATTGTTATCGATAATGTCATGCTAAGAGTTATGATAAGGTTAAGCTCTTAATTTTTAGTGAGTATGATGATGTAGTTATTAGTAATTTTATGTATTGACAATGACACTCTCCTATGAGAGAAAATTATTTTGCTGCATTTTATACACCACTTTATGTAATAAAATGTTATTTATAATGTTGTGTTGCAAGAGCATTTTTAAGATGCATGCTATGTGCAATAAAGGGAGGTGTAGAATTATTTTTGATAATGATAGCGATGTGAATGTAATTCCTACCTATGCATGCATACACACAAGCTAGTTTGAACTTGAAACTCTCTTTGTGCCAATCCACATAAACTGGATGAACATTTTACCAAGGATTATTTTATTCCAGTCTTTATCAAGCTATCTAGTTATGAGGAGTTATTTGATACGGTGTACTCCCCTTAGAATTTTATTTACAAGTCTATGGCTTTATTATTAATGTGTAATTTACTTTGATCGTAAAAATATTTAGATTTCCTAGTTCCATTAGAATCATTTTTTATAAAAGCTTGAAAGCGTTGGCTCAAAAGCTTAAGATCTCCAAATTGTAACTAATTGTTATTAACCTACCCCAATTTCTTGCTAGAGGTTTCTTAGCCTTGACCAACCTAAAAAATTAAGCCCTGAGATTCATTCCATCCATTTTGGATGCCTTCATATCTTTTGTGAGTACTTGGTTCTATCATTTCCCATCTTCTTCATGTCAGAGAAGTAATCCCCATTCAATTTAAGTAGAAATCAAACTCGAGGTATATTCTTGTTTTTTTAATGTTGGAACTATTTTTTATGATCATTCAAATGTGCTTCAATCTCTGCAGAATATTCAATATGTTATCGATCTCCTGCTAGATTGACAACTGTCGAACCTTCTTCACTGTTTTATGAATTAGTTGAACACACTGAGTTGAAGTGTCAACTTGATGTGTTACGTGGGATATTTTTTTTTGAGGAGAGCTTAACAAATTGTGCAATGCCCACATTATTAATTCTGATGGATCATGGAAAATGCTTGTATTGTCCTATCATAAAAAAGATCCTTATTAAATATCTATTCCATTGCCTTCATCTTGATGACTTATTCAATCTTATTTCTAGATCAATTTTTTTTTCCTCCAAAATTGCTACCATTAGATTTGGATTTTTCCTAACGACGAGTGCAAGTTCACCATCAAAACAGATTATCGAACTTTATGAGTGTCTTGGATGCCATTTGTTATATTGAATGCTATTGACAATTAACTATTTATTTTTGGGTCATAAATTTCTTGCAACTTGCCAAACTATTCATGAAATTACTTGAAAAGTTACGAGATAAAGCCATAAGTTTCATTTGTACCATCTTACACGGTTCAGTGATTTCTATTTTCAAAATTATCAAATATCAAAATGTATGTAGTCCATCCTGCATCTGGATTTTTTTCTGGTTACTATAACATCATTTATCCTCATATATCTCTCACTAACCTTAAAATAATTGTGAATTAGATGTAAAGAAGCTAAAATACAAAAAGGCACTAGTTTTGACTTCTACTTTTTTAAATTTAATCTATTTAAATTTTTTGATGAATGGTAAGAGAGTAGCATGAGAAGTAAATCTATTCTAAATAAGTAATAGTATTCCTCTCTCTTTATATACATATTTAAATGGATAAACTTCATTCATTATATGTAGAGATCTATTCTAAGAAAAGTAATAGTATTCCTCTCTTTTTAAATACATATTCAAATGGATAAACTACATTTTTATATGAAGAGAATTTTGTTTTGGCACATCACACGATTTATTTTAATAATTTAAAGGATGATAACCAAGGCACATTTTCATATATGTAAACTATAGTGTAATTAATTAAAAAAGACGTTGGCATTTAGTGGGGGATAATGGAGAACTACCACATGGTTAGAATTTTGTACTAAAAGATCGAAATTAGAATGTATTGTGTTAATGTATATTATACGATATCACAGTTTAAGATTTTTTGTATCAAGAAGATTGCGATCAAATATCTTGATCTACCATAGAAAATAATGGTAGAATAGAGGGAAGTATAGTTAATATGATTTAACCATGTTAGATAAAATGGAGGACCCCACATGTGATGTTGTGTGATTGAAAGGATTCACCCAAGCTTAAATTATTGTACAAAATATTGACTTGCAAAGTGAAATAACACTAACAAAATAAATGTTGTGGAGATGAGGAAATTAAGATGGATGAGTGGGTGTACTTGAAATGATATGATGAGAATGAGTGCATTCATGAAAAGTTTGAAGTAGCGTTAGTTGCGTTCATGAGCTATGTTGGGTTTTTCTACAGAGAGAGTCGTTGGGTCTGATCAAATACAAGAATTGTTGATGAGGGCAAGATGATGGATTAATGTTGATCCAAATTGAGCAGGGCTAACTGTTGGAACTTATGATTGTATATGCCATTATTTTTATACACACACACACGCCATACATGCACATGCTGATGAGAGCAAGATGATGGGTTAATGCTTTTTTTCTTGTTTTGTTGTACCACAATTCATTTGGTTATTTATACTAGCATAATTTGCAATTTATTTTATGTTTTCTCTCAATTGACATGCTGATCACATAGATTTGCTGTAGAAAAGTACTGCAAGCTCTTACTAATTACAAATCTCATGACAAAAAGACTTGTTGATGGGATCTTTATTTGCACCTACTTAATTCAACACTCAGTTCGTTGGAGATGAGACCATCCTCCCTTTCCGCTATGGAGAATGTTGGATCATCTAGTGAAGATGCAGTTGTTACATTTGATGGTATTGCTGAGGACAGTACAATATGGAACTTCATCTTTCACTCATGAGGCTTCAAGGGCAAGCTAATGATTTCAAAATTTACTGGAACAGTGTAATTTAGGAATTTTCAATTGCCTATGTTCTCAAACTTACAAATTACCTTTTGTTTGAATTAATTAGTTTGTCATATCATCCTGCAATTCTTAGGTGTTAAGTTTTTTTCTTAATTCAAATTATTTATTGCATTTTGCTTAAATATCAATCTGTTCATGTGATACCTCATGAATTACCTTTAGTTTAACTTGTCTTATGCAATTCAATCAGCCCCATACTTTTGTTGTGGTGACCCTTGATCCTGTAGAGGGAAGACTTTGTAAAATTGTCTCTCAGGTTAAATCTCTTATTATATTTTGTGCTATGTAATTTCTCAATCTTCAGAAAGTAATTGTTAACTTCAAAATTTATTTAGCACTACTTTATTTTGATGCATGTTTGCTCTTAAAAGTGAAGCAAAAAGTGTTGTTGAAGGTAGTTTGACCATTAGCGAGGAACTCTTGGCAACAAAATTAAAGGGAAAGTTGACAGAGATGTCCTAATAGGTAAATACTTCTCTTTTACTTATGCAACACATTATAATTGAACTATATGCAATCTTGAGTTTTCAAATATAAATATTTCTTTTGATTTATGCTCTTCAATCTTCAGACATTTGAACATAGGATATCATAGAGTGTATATATTAATAATAGAGTGTATGTCTAATAATTGTAGGGAAAATTAATATTCGTACATTTTAATAAATGTCAAAG

Network for GWHGAAEX011161

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation
Module7

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
--	--	--	--	--

Protein Sequence

>GWHPAAEX011161
LLYTHLSSLLFSTIMFLHNYFGVLCCLHLLLCNVYLLLIKISNTLNTYILEMFDDLSYIAHIEFRLLVYYLHKRFDKSHCRSKFIFFLNTHLIEIHYYTTIIAYRHLHTTLFVGTIVTLEEHENLNTLPLQVEHHNPLPHAQKMNRENTLNHEDVLHASCLNMKIDTLKFDETYVPNKFLIAFNSMLFLSSITMVMIISILKSYSCTLLLDQQSSKKTMLGLATYYLGDHNCSGEIFSTSYLVASRATCYLDSTYFYSLNTFTVFYTLYFDWYLAIILLLGLKPNICNDESFRSASSFSSSQVLSHTHFFISLFLLLILIQPWLSFYLEFHYLGPILCPFIRSLSPLLLLSIMSCELGALNFVCSYFYVLTMTLSYERKLFCCILYTTLCNKMLFIMLCCKSIFKMHAMCNKGRCRIIFDNDSDVNVIPTYACIHTSFELETLFVPIHINWMNILPRIILFQSLSSYLVMRSYLIRCTPLRILFTSLWLYYCVIYFDRKNIISFHNHFLKLESVGSKADLQIVTNCYPTPISCRFLSLDQPKKLSPEIHSIHFGCLHIFCEYLVLSFPIFFMSEKSPFNLSRNQTRGIFLFFCWNYFLSFKCASISAEYSICYRSPARLTTVEPSSLFYELVEHTELKCQLDVLRGIFFFEESLTNCAMPTLLILMDHGKCLYCPIIKKILIKYLFHCLHLDDLFNLISRSIFFSSKIATIRFGFFLTTSASSPSKQIIELYECLGCHLLYMLLTINYLFLGHKFLATCQTIHEITKVTRSHKFHLYHLTRFSDFYFQNYQISKCMSILHLDFFLVTITSFILIYLSLTLKLIRCKEAKIQKGTSFDFYFFKFNLFKFFDEWESSMRSKSILNKYSSLFIYIFKWINFIHYMRSILRKVIVFLSFIHIQMDKLHFYMKRILFWHITRFILIIRMITKAHFHICKLCNLKKTLAFSGGWRTTTWLEFCTKRSKLECIVLMYIIRYHSLRFFVSRRLRSNILIYHRKWNRGKYSYDLTMLDKMEDPTCDVVLKGFTQAIIVQNIDLQSEITLTKMLWRGNDGVGVLEMIEVHSKVSSVSCVHELCWVFLQRESLGLIKYKNCGQDDGLMLIQIEQGLLELMIVYAIIFIHTHTPYMHMLMRARWVNAFFLVLLYHNSFGYLYHNLQFILCFLSIDMLITICCRKVLQALTNYKSHDKKTCWDLYLHLLNSTLSSLEMRPSSLSAMENVGSSSEDAVVTFDGIAEDSTIWNFIFHSGFKGKLMISKFTGTVFRNFQLPMFSNLQITFCLNLVCHIILQFLGVKFFSFKLFIAFCLNINLFMYLMNYLFNLSYAIQSAPYFCCGDPSCRGKTLNCLSGISYYILCYVISQSSESNCLQNLFSTTLFCMFALKSEAKSVVEGSLTISEELLATKLKGKLTEMSVNTSLLLMQHIIIELYAILSFQIIFLLIYALQSSDITDIIECIYSVCLIIVGKINIRTFMSK

Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	8.210
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	20.620
SRP108465	SRR5643513	five period of Gastrodia elata	2.420
	SRR5643514	five period of Gastrodia elata	3.720
	SRR5643515	five period of Gastrodia elata	4.430
	SRR5643524	five period of Gastrodia elata	5.050
	SRR5643525	five period of Gastrodia elata	1.550
	SRR5643528	five period of Gastrodia elata	0.890
	SRR5643658	five period of Gastrodia elata	1.060
	SRR5643659	five period of Gastrodia elata	8.720
	SRR5643660	five period of Gastrodia elata	9.780
	SRR5643661	five period of Gastrodia elata	7.600
	SRR5643662	five period of Gastrodia elata	4.470
	SRR5643663	five period of Gastrodia elata	7.610
	SRR5643664	five period of Gastrodia elata	4.150
SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	2.350
	SRR6049655	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	2.690
	SRR6049656	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	0.880
	SRR6049657	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	2.540
	SRR6049658	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	0.010
	SRR6049659	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	0.000
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	SRR6049661	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	0.000
	SRR6049662	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	0.380
	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	0.000
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	1.990
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	1.990
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	21.24
	Juven	Juvenile tuber	19.60
	Mother_Gastro	Mother tuber of Gastrodia elata	9.59
	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	12.46