Gene detail

Detail information of GWHGAAEX011869/CADD00962.4.gene

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation
nr	gi\|743882357\|ref\|XP_010909133.1\|	5.20E-112	PREDICTED: protein FAR1-RELATED SEQUENCE 6-like [Elaeis guineensis]
Swissprot	tr\|Q9SZL8\|FRS5_ARATH	5.00E-49	Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5
trEMBL	tr\|Q2QZM0\|Q2QZM0_ORYSJ	1.00E-78	Transposon protein, putative, unclassified {ECO:0000313\|EMBL:ABA95414.1}
TAIR	AT4G38180	2.00E-48	FAR1-related sequence 5

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000011	3699574	3706775	-

Transcript Sequence
>GWHTAAEX011869 CATTTGGATAATTACGATTAAGAGAGAAATTCGGAACAAGATAGTATGGCTGAGTTTGTATTTTTGAGAAGATTCAATTCATCTTATATTTATATATGGAAATAATAATATAATATTTTAATTAAATAGTATGAGTAAGAAATAAAAAATACGAGGATCATATTTAAGTGAATAGAACCAAACATAGGATTTCTTGAAAAAACTTTGGGTCACCGTAGTATTAATGAGTTAGTATTTTTGATAAGATTCTATTCATCTAGCTATATATAATATTTTAAAGTGAGAAATATAGCATTTTAATTTATATTTATTAAAATTAAGAGAAATTGTGAATTTTACAATTCAAGATTTCAATTTCTATTAGGACAATGCTACACTACACCCTAATAACTCACAAAAATATGAATGACATGGATTCTGACGTGGCAAGCCAGGCCACGTCAGCATTTTTCTTATACCCCTCCCTCCCTCAACGATAATCTAATCTCCCGAATCTCCAGCCGCTTTCTTTTGGCAAGCCGATCTCCCGAAAAGCGCACGAGCAGCTTTCCTTTCCCCCTCTTCCCGTTTGTGTCCTTCACCTCTTGTCCGAGCGATCATTCACCTCTCGTCCCTAAACATTGCTAAGATTAGCGTCGCCCGAAGACCTATTCGCACCGACCAGCTTTCCTTTTTTCCTTTCCCCATTTTGCTCCTGCTAGGGTTTGCGGCGACGCTAACCGAGCGATCCTTCACGTCTCGTCCTTAAGGTACGCCGCAGCTTAGATTGACGACTCATGAATGATTGGCCGCGTCTTACGGTTTGATCTTTCTCCCCTTTAAAATCCATTTGCAAAATTTTTTGAGCGAGAAAAAAGAACTTTGTTTTGGTAGATAATGGTTGCTTTCATCTCTGTTGGTCGTTCTCGGCTCAGCTGTTTTTTTTCCCTCTGGCAGCATTGTGGTTCTGTATTATAGATGTGCGATGTTTGGCGTTCTTATTTATGAACGAACGATTATTTTCTTCGACGCCTGAAGGGAGGAATTTTTTCTATACATATCGCACTAATTTTATGAAACTGATTTTTGTTCTTTATTATTGACATTAATTATTAAGACCTAAGCGGGGAAAACCCATAAATTGGTAAAAGCTGCAAAAACATTAATGCTGTTGTTGTATGATGTACTTTACATTATTTTATGTTTAACTTTAATTAGATGTTATTAGAGTGATGTTATGAATTCTGCAACTGACTATTCTTATACTATTAGATGCTGCATTTTACATTATCTTTCTACGAATTTTCTTAACTATTGTCGTATGCTCTTCTGGGTGTTGATTTTTTGATGAGTTCTATTAAATAAGCATTTTATAATGAAATAATGGCTCATCACATAGAGGCTAATTTTTATATTAAGAGTGGATGATATAATTAAACCCTACTTTGGTATTTAATTATCATTACTTGTAGCTTGTGTTTGGAAGTGCTATCGCACGATATTGGTCATAAGCACATTTGTGTGCTGAGTTAAAACTCTACAACATATTTTGTATGCTAAAATAATCTACATTTAAGGAGGCGCACTTTACTTAATAAGAGAGGCAAGGCTTGATCTTTAATTAGAGATATACTTCATTCATAAGTTTTGGAGATACTTCATTCATGATGATACTTTTTGTAAATTGTCTTATGAAGTGATGAGGCTATGATGCACTATTAATAATTTTTATCTGTTTTTTATATTTTTCCTTGCTTGGACCCCAACTGGAGCTTTTGTTTTCCACTTTGTTTTGGGAGGAGTATATTGGCAGGTTTTTTATTTGAGACAATGATGGATTGTGATGCTATTTTAGACCTCATTTGACGGTTTGGTGACTTCCTTTGGTAAATACCCCTTGAATAAATTCTACACTGATTTTAAGGATTGATGCTCTGTCGGGTCTTTGGTCTTCTGTAGGTCTCATTTGGAGGAGTTGAACCCTAGTCTTCTAGTTTTGAGTTTTTTATTTATTTTTGCTTTTATATGTAATTTGAGTCATTGAGCCTTTCTTTTTCTTTGTAAGTATTTTTGCTTTCATATGCAATCCTAATCTTTTATAAGCTTATAAGTTATTTTAAAATTATATTTATTATGCTTATTTTGCCTAATTGTTATCTTAGTTTGCAAATACATACATATGGATGCTACAAACACCACACCTCATTTCATTGATGATGTTAGCAATTTTGGAGAACGAACATTGCCAATGATAATCGAATTGGAGTTGGAATGTTGCCCGCAATCAGAAAAAGAATTGCTAGTAGATAACAACTCAGGTTAATTATTGTGCATATTAATTATTATGTTGGAACAAAATATTATATTATTACATTATTACAGCATTGACTAGTTTTAATTCTATTAATGCATGTTTAGAGATTTTAGACAATTGTGTGAATGAAAGTGATCATGTATTTGAAACTAACGAATTTTTTTTTTAAATCTCTGAGATTGGAATGAGATTTAGTTCTCTTGAAGAAGCATTTAAATAGTACAAAATTTATGGGTATTATAGTGATTTTGGCATTAGAAAACGTTCAAATCATAATTTTTATGGGCAAAAAACTTATTATGTGTTTACTTGTTGTAAAGAGGAAGCCACATGTAACAACAAAAATAACAAAATTACGTAGAAAACTGATAATAACAACATGTTGCAAGATAAAATTTGTTATTTTAGATCGTTGTTTAAACTCCAAATGTGTAATTGATGATATTTTCTTGGAGCATAATCATGATTTGGAGCCTCAAATGGTTCGTTTTATGCGATGCTACCGTGAGCTACCTTTGATTATCCAAAGACAGTTGATAGTTAATAATAAGGTTGGAGTTTCGCTAAATAAATCTATTAATGCAATGTTTACACTATGTGGGGGATTTGATAATTATTTATTTATTGAAAAGGATTGTAGAAATTTTGTGACAAAGCATAAAGCATTGAATTTAGTTGATGAGGATGTAGTTGCTTTAATTAAATATTTTGAAAGATTGCAAAATGAGACTCAAAATTTTTCTACAGTATTGATGTGACAGATGATAATCGACTGAATTTGGGCTGATTCGCGGTGTCAAATGACATATGATCATTTTGACGATGTTGTGACGTTTGATACCACATATCTCACAAATCGGTATGACATGCCCTTTGCACCATTTGTGAGTGAATCATCATGAAAACTCTATTCTTTCGGTTGTGCATTATTATGTGATGAAACAAGTGAAACATTTTTATGGTTGTTTAAGCGGATGTTAGCTTGCATGCATGATAAACATCTAAACGGAATAATAACTGATCAATGTCGAGCAATAGAATATGTAATTTTTGAGGTGTTTCCATCTACAAAGCACCGTCTTTGTTTGTGGCATATCATACAGAAATTGTCAGAAAAACTAGGCGGTAGATTAGATAAATAATCGTTAATCTCTGAATTTTCACCTATTGTTTATGACTCTTTGTCTGGGGATGAGTTTGAACACGGTTGGTTGACGGTGATGTCAAATACCAGCTTATTGAAATTAATTGGTTTACGTCTCTTTATGAGAAAAGGGCGAACTAGGTTCCCATATTCTTGAAAGATTTTTTCTGGGCTGGAATGTCTACTACACAACAAAGTGAAGGCGTAAATGCTTTCTTTGATGGGTACGTGAATTCGAAGACAACTCTACATTTATTTGTTGAGCAATATGAAAATGCTTAAAGATAAGTTCGAAAAACAAGCTCAAGCTGATTTTAAATCATATATTTCTCAACCACAATTTATCTCAAATCTAGTTTATGAAGAACAGTTCTCTAAAACATATACTTTAAATATATTTTACAAATTCCAGGATGAAGTAAAGAAATTGATGAACTGTATTATCTCAAATGCATAGCTTAATGTGTCGTTTAAAATATATATGGTAATTGTGTGGGATGGAATGAGAAGACTTGATTTTAGAATTGTTTATAATCTCATCGAAGAGGATATGTGGTGCATTTGCCGCTCATTCCAGTTTAGCGGGACTGTTTGTTCACACATACTGTGTGTTTTGCGTCAAGAAGGGAATGCCAGAATTCCTGACAAATTAGTAAGCTCATGATGGAGAAAGGATAATAAACAATTTGCTCATTTATTAGATTCTTCAACTCACAAACAAACATTAAAAGTAGATCGGATGACTATTATGTTGAAAGCATACGACATGCCAATGAGATTAATTATATTGGGGGAGTTAATGATGAGGCTCGTGCATACACATTAGCTGCCTTACAAGAGCTTAAAGAAAAGATTAAAGATTTTTGTGGTCATGGAGTTCCAAGTGCAATAAAAGATCCTGCTCGCGCACACCCAAAAGGACGCCCGCCAACCAAGAGACTTATAAGTCATCATGACAGAAAAGGGAAGAAGAAGCATATGCTGTAATTTTCAAGTTTCTTTTGTTCTTATTGGCTTAATATTTTTATTCATTTGTAAAACTGTTTCTTATGTTTTTATTTTCTGCTTTATATAGGCGCTCAAAATGTTTTCTTTACTTTTATGCCAATATACTAATGCTTCAATTGCTATAATTTGATATTTAATTAGTCATCCCCTATATAACACCTTCACATAATTTACTGTTGATCTTTATAAGTTATCCAAAAAGTTTTTTTTATAGCAATACTTAGATACTGAGATAACTAAGAAACAAATTAGAAATCATACTGAGATAACTAAGAAACAAACTAGAAATTAGTTGAACATGTACTAAACGAAGAACTGGAGCCTTCTGTTGTTTTGATTATGTCACCTAATGAATTGAAGGTACACATTTTATATTTGTGACGCTTGATGAATTAGATAGTTTTAAGAAACTTTGCACATTTGTATAAATTTGTTTTTATATATGTTCAAATGCTATTAAAACTGTTTATTTTGCATATCGTTGTGTAGACATGGAGAGATGGAAAGCAATCCTAAAATAAAAACTTCAGGATTGGGGAGACCATCTTGGACATGTAACTGGGTGGTATGCATTAATCTCGTAAAGAGGCTTTCACTAACTTTGTTTTGATCACTTTGAATTGAAGATTTAAATTTTGTTATCTGTGTAAGCATTGGTACAATTGTGAGCTTTGTATAACATAGTGTGGTTATTTTGAATTTTTTTTGTTATTGATGTTATTGGTGAAATTGTGGGCTTCGGCATTGGTGAAATTGTGGGCTGTGTATAACTATTATTGAAGATAGTCATATCTTGTATGTTTTCCTCTCCTGGTAAGTATGGAATTGATGCATGTTTAATTTTGTAAAGTCTTTAAGCAATGTTTATTTTTACTGGAACTCTATTCAATTTTTATTCATAATCCTTTGGAGCTTATCTCCTTTGTCTCAGCCAAGTTATTTTTTCTTGGAAATGAAGACTCGGTTAATTTTGGATGGCCATATACCCTCAAATATACTAGTATATTAGCAATCACTAATCAGAGCTCTCCTTCTAAACAAGACCTTTTCTTGTTTAAACTGCATCTTCCTTTGTTTCTTAAGATGGTTTGGTTAGCTGGAAGTTATATGGTGTGCTGATGTGTATGGGTGTCAATTTTGCTCTAGATCTCTCCGGCATCTTGGTTTTTACTGTAAGGCCTAGGTAAGGCTAGTGTATGATGGTGACAGTTTTTGCTCAAGTCTCGATCTCTCAGCAATATGGTCTTCGGCAAATATGTTTGTGTTGCTTTGAATATTTAATGCTTGCAGGTTGTTGTGATCTAGTCTTTTATCTTCTTGCTACTGAACATTAGATTGTTGATTGGTTTTGTGGATGTGGTTGTAGTTGTGCTAAATTTCACTAAAACAATCTAACTTCGAATATATGTTGTGAAGATTTTTATTGCAACGGTAATCATGTCGACAATGTTCTGTGGATCTACGAGGCAGACTGACAGCATAGAAGATAACGATATGTACAACAATGCCATTATTTTCGGCATTTCCATCAATATTTTCAATAGCATGTCGCAGCTGCCCCTTACAATAAGCAGGCTGCCAGTGTTCTACCAGCAACGAGACCTCAACTTGTACCCCACATGAGTCTTCACCCTACCTAACTTTGTTCCCTGAATCCCCATCGCCATGCTCAAATCATTTCTTTGGGTGGTCACAACCTACTACTCAATTGGGTTTGCACCAGGAGCTAGTTGGTGAGCCCGGCACCTCACTAAAGCAACACATCAAAAATTGGTTGCAGCAATGTGTAGATCAATAAATATTTCAAACACCTGCCAGACTGTGTCGTCATTATTTTTATTCTAACACAAAGCTCATGATTGATGAGGCTTATTCAGCTTTATCCGCTATCACACAAAGGATATTTTCTTCAACTCTGAGCTAGTATGGGCACAAAGTTTGTAATGATGAATTTGGCACATCATTCATCAACATCATATTTTAGTGAAAATGATTTTGCTGTAAGAGTGCAACCAGCCAGACAGAGTAGAGCTGTTCAAATTAAACAACTAATATTTGTGGATCAAATGCCATTGGAGTTGTTGTATTTTTATTGAACAAAAATGTTAATTAAAACATTTTCAAAAAAAAAAATTATTTATATTAAAATTTGTTTTTTGCTCAGCATAATTTGGGATCACTTGTTTATGCTATTGATGTAAATAAAGTTATTTTTGTAATAATGTGTGTACTGTATTTTGGATGTTTTCTAAGTTTAATTGATATTTTGATTTGTGTTGTTCTATATTCATTATTTTGGTGATCTGGAATATAGGTAACTAAAAGTATATCCTCTCCTACTAGTCAATATGATCCAATTCTTAATAGCATTGAGCCTTCATAAACTGACACTATTAATAAAATCAGGTGTTCTGATCTAAATTCAG

Network for GWHGAAEX011869

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation
Module7

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
PF10551.8	MULE	978	1069	4.50E-22

Protein Sequence

>GWHPAAEX011869
HLDNYDERNSEQDSMAEFVFLRRFNSSYIYIWKYNILIKYEEIKNTRIIFKIEPNIGFLEKTLGHRSINELVFLIRFYSSSYIYFKVRNIAFFIFIKIKRNCEFYNSRFQFLLGQCYTTPLTKIMTWILTWQARPRQHFSYTPPSLNDNLISRISSRFLLASRSPEKRTSSFPFPLFPFVSFTSCPSDHSPLVPKHCDRRPKTYSHRPAFLFSFPHFAPARVCGDANRAILHVSSLRYAAAIDDSMIGRVLRFDLSPLNPFAKFFEREKRTLFWIMVAFISVGRSRLSCFFSLWQHCGSVLMCDVWRSYLTNDYFLRRLKGGIFSIHIALILNFLFFIIDINYDLSGENPIGKSCKNINAVVVCTLHYFMFNFNMLLECYEFCNLFLYYMLHFTLSFYEFSLLSYALLGVDFLMSSIKAFYNEIMAHHIEANFYIKSGYNTLLWYLIIITCSLCLEVLSHDIGHKHICVLSNSTTYFVCNNLHLRRRTLLNKRGKASLIRDILHSVLEILHSYFLIVLSDEAMMHYFLSVFYIFPCLDPNWSFCFPLCFGRSILAGFLFETMMDCDAILDLIRFGDFLWIPLEILHFGLMLCRVFGLLVSFGGVEPSSSFEFFIYFCFYMFESLSLSFSLVFLLSYAILIFYKLISYFKIIFIMLILPNCYLSLQIHTYGCYKHHTSFHCQFWRTNIANDNRIGVGMLPAIRKRIASRQLRLIIVHINYYVGTKYYIITLLQHLVLILLMHVRFTIVMKVIMYLKLTNFFFKSLRLEDLVLLKKHLNSTKFMGIIVILALENVQIIIFMGKKLIMCLLVVKRKPHVTTKITKLRRKLIITTCCKIKFVILDRCLNSKCVIDDIFLEHNHDLEPQMVRFMRCYRELPLIIQRQLIVNNKVGVSLNKSINAMFTLCGGFDNYLFIEKDCRNFVTKHKALNLVDEDVVALIKYFERLQNETQNFSTVLMQMIIDIWADSRCQMTYDHFDDVVTFDTTYLTNRYDMPFAPFVSESSKLYSFGCALLCDETSETFLWLFKRMLACMHDKHLNGIITDQCRAIEYVIFEVFPSTKHRLCLWHIIQKLSEKLGGRLDKSLISEFSPIVYDSLSGDEFEHGWLTVMSNTSLLKLIGLRLFMRKGRTRFPYSKIFSGLECLLHNKVKAMLSLMGTIRRQLYIYLLSNMKMLKDKFEKQAQADFKSYISQPQFISNLVYEEQFSKTYTLNIFYKFQDEVKKLMNCIISNALNVSFKIYMVIVWDGMRRLDFRIVYNLIEEDMWCICRSFQFSGTVCSHILCVLRQEGNARIPDKLVSSWRKDNKQFAHLLDSSTHKQTLKVDRMTIMLKAYDMPMRLIILGELMMRLVHTHLPYKSLKKRLKIFVVMEFQVQKILLAHTQKDARQPRDLVIMTEKGRRSICCNFQVSFVLIGLIFLFICKTVSYVFIFCFIALKMFSLLLCQYTNASIAIIYLISHPLYNTFTFTVDLYKLSKKFFLQYLDTEITKKQIRNHTEITKKQTRNLNMYTKNWSLLLFLCHLMNRYTFYICDAIRFETLHICINLFLYMFKCYNCLFCISLCRHGEMESNPKIKTSGLGRPSWTCNWVVCINLVKRLSLTLFSLIEDLNFVICVSIGTIVSFVHSVVILNFFCYCYWNCGLRHWNCGLCITIIEDSHILYVFLSWVWNCMFNFVKSLSNVYFYWNSIQFLFIILWSLSPLSQPSYFFLEMKTRLILDGHIPSNILVYQSLIRALLLNKTFSCLNCIFLCFLRWFGLEVIWCADVYGCQFCSRSLRHLGFYCKAVRLVYDGDSFCSSLDLSAIWSSANMFVLLIFNACRLLSSLLSSCYTLDCLVLWMWLLCISLKQSNFEYMLRFLLQRSCRQCSVDLRGRLTAKITICTTMPLFSAFPSIFSIACRSCPLQAGCQCSTSNETSTCTPHESSPYLTLFPESPSPCSNHFFGWSQPTTQLGLHQELVGEPGTSLKQHIKNWLQQCVDQIFQTPARLCRHYFYSNTKLMIDEAYSALSAITQRIFSSTLSYGHKVCNDEFGTSFINIIFKFCCKSATSQTESCSNTTNICGSNAIGVVVFLLNKNVNNIFKKKNYLYNLFFAQHNLGSLVYAIDVNKVIFVIMCVLYFGCFLSLIDILICVVLYSLFWSGIVTKSISSPTSQYDPILNSIEPSTDTINKIRCSDLNS

Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name
GO:0008270	Molecular Function	zinc ion binding

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	2.650
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	3.950
SRP108465	SRR5643513	five period of Gastrodia elata	2.070
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	SRR5643659	five period of Gastrodia elata	2.510
	SRR5643660	five period of Gastrodia elata	3.370
	SRR5643661	five period of Gastrodia elata	1.210
	SRR5643662	five period of Gastrodia elata	1.270
	SRR5643663	five period of Gastrodia elata	2.730
	SRR5643664	five period of Gastrodia elata	1.620
SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	1.250
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	SRR6049659	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	0.340
	SRR6049660	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	1.690
	SRR6049661	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	0.170
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	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	1.890
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	0.520
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	0.520
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	3.00
	Juven	Juvenile tuber	4.25
	Mother_Gastro	Mother tuber of Gastrodia elata	2.48
	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	5.46