Gene detail

Detail information of GWHGAAEX012102/CADD00971.1.gene

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000038	2999296	3017362	+

Transcript Sequence
>GWHTAAEX012102 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ATGTTTTACAACCCTACGATATTGCAATACCCAATTTTATTTTCATGTTCAAGCGCATGTAGCGAATTGTTTGTTCGATGTCCAACAATTTGATGTTAAAGAAACATGATTTACACACTTTGAGCAAATAGATTGAAATATGATTGCTAAATAAAAGAGATGCATTTCAGTTGTGATAATCATTTTGTTAAAATGTTTCTAATCGTTTGGGCATTATATGAGCATGTAATGAAAATACTATTAAGTCAGACCAACACATCATTCTTTGTTTATATTTACAGGGTTGAAAACCTCTATTTATTGTGAGCTTGTATTAACATTAGGCAAATATTTATGTGCCTAAAACAATTTGCCTTGTGGCAGTGCCATTCATTGATTTTACCCTCTCACGCTTAAAGACATTACCGATACACAATACTTCTTTTGTTCATGCAATGAAATTGAGAAATAGAATTTTGAAGCCACACTTCACAATCCGCAGTTACAAGCTTACAGAGCTACAAACTTAAGAGTTAGATACAACAATGGCCTTACTGATAAGTTCAAAATACAATAATATAACGGTTACAATGCACAGAAATGTCAAATAAACTAGTGCACCAGTGTATCTCACTAGTATAATAGACGGCCATCTTGATTCTTTGACCAAGAAAAAATAATAATTATTTTTTTCAAGCAAGTTATAATTTGGATTTGTGTAGTGTGTGTTATTTTGCCAATTCACTTTTAAAATTTTACTTATTCACAGAAAATCAACACTTGGTCTCATCAGTTCACAGAAGGAAACACTTTGAGATGCAGATTAATTGAAACTGTTCTTAAGCTGATGTCACTCTTAAGTTGTATTTTTGTCTCTTGCATTGTGATTTTGTTTAGGATATGTGCGATGATAATGCGCTATGTATATAGCAATGGATAGACATTCTAGCACTTATTTCCAGGTAACAAGTAATCGCTTGCTTTCTCACCATTTTGTTTGTTCTTTCATTTGCATTTGAAAGTATTTTCTTGAGGTATAAAAACTACAAATACT

Network for GWHGAAEX012102

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation
Module7

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
--	--	--	--	--

Protein Sequence

>GWHPAAEX012102
ATQPLMAPFLALSELFSELPSDETFPDTTSRSVIRGKEIEIALVDGFDVRSVLHLGVNVGCAYHCLYLSRLLKPQLVMDLSNQVIGVTLAFIFIYFPNYITKISAVCMYYSNSFSLLIFCFIFCAIIEFWSMVLFLSWFLDYNFQNLFYKPKLLDDYVCVQARKLYVEKYNYFYIINLNILMRLSMKVVSRKIHWNSILILDLYYLALVSMIYFCLQFWKILSFRFLYFKNLLFLIFNCRREFMTFLNILFFILLWILWYLFYLQFWKTFSFKFPYWFKICYFLFIEAEELDLLKYFIFVDCPDALTLKYFSIYHEKKQLLFLKFYFSVMLHLSCLGTVDNPYFDGVSKTISQVFSFWATLIFFRGVRTSLRIIYHFFGCVVFARNMHDNGSVQAQSETFHIIMLIIVALILQNKIILFLAFSWLLICLSFIIMILITPLKPYAIAIISYWIAQLGCQGDIICMVCRRHYDSLGFTILILTKIFFIVSLFSIYKNSHQIYFLASCSCLRRYNLYKPPRTFMGKGSHSYVRISSNACFWPLGSSKALFDFPFISHACTSTIFNRQPFRCKSYQIKQACINTLQNFYFFPVALISMFRHFFFQMDIVTEMGRFFSACMYLLACPFTIFNKHKLRLLMFCHVPIKWLVLHRDGFEPNSIELIRTWNINSSLVTRLKLSSSINKLINFEIILKYFNKVSILKFCTLTNQILKLNVVKNIVIKKVLNRNIFVHYLRAIRQILMHYIVLNQPSHLQRLNNTTTNSINQLINETSINYMLNNIFSLNNFINIDYKVTNHPKILTKKALLQLQSVPVISPKTGPGMACSWTNVLTYKMHNEQLIFEMNQVFNQTLISFKVGFLKQFKLFVKLIKLNSCNSVSLGCNYMQATVTCNIIKFIIYNKTSKELNNSMSSLKKLESKLNKLVKIYNVNNTQIPLKKFDPFSFVNDYNLYMGASTNDLSKLAHLSFTRHHLVISSNCSNTIWASTNQILNQHIYLNYTINSNYEIVIEITYARTKYLLNTNLLKTIMTCRYKYANSGRIQIIVEYWNMTLSTTILSCDVISYDIIHVIFQMIISYHCPFFPLLHTLFQIKNFQVASVRFVVFHKICQVANCIYSFEHHNIGLNCINPQFTSLDCIISHLEFRMKMELPNQFNSIIAEHWRDLHLNITRVNMAILQYTSTGTKWTLDKIISLDWCFSHNNYDTMMKVQHYIIAEMQIRPLFGMDALGMLDVRGFLHSLYKLFQYMIYLIWRQSIEYMQIHSIQQWKTIIELHSIKCSALILDNLNILLLKSSLDYNRTRQQSNAELISNYQDDNSQINNISNINIMPNLRLILMQQLLGESRNILAIFFGSYFVQKLFYCKEKGCSTMVAIVSMRVLGVSTELYNSCKLSNIHIFHQVYIHCMHIKIQICVIFCLGASIIAIHMIKLLLAQYFNFIFMFKHINLTKSSLSHAPLLHVSHNFYVSLHCMMHLPMTLAMTPALYRGSILTLLRCTFYLYPQHLHYIEDQYHYSEYDRYHMLQPHSSPTYVNIDLECYIYCEYKQRKTCFTTLRYCNTQFYFHVQAHVANCLFDVQQFDVKETFTHFEQIDNMIAKKRCISVVIIILLKCFSFGHYMSMKYYVRPTHHSLFIFTGLKTSIYCELVLTLGKYLCANNLPCGSAIHFYPLTLKDITDTQYFFCSCNEIEKNFEATLHNPQLQAYRATNLRVRYNNGLTDKFKIQYNGYNAQKCQINCTSVSHYNRRPSFFDQEKIIIIFFKQVIIWICVVCVILPIHFNFTYSQKINTWSHQFTEGNTLRCRLIETVLKLMSLLSCIFVSCIVILFRICAMIMRYVYSNGTFHLFPGNKSLAFSPFCLFFHLHLKVFSGIKTTNT

Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	2.520
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	1.580
SRP108465	SRR5643513	five period of Gastrodia elata	1.430
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	SRR5643664	five period of Gastrodia elata	1.600
SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	2.230
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	SRR6049662	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	1.050
	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	1.510
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	1.450
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	1.450
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	8.36
	Juven	Juvenile tuber	7.84
	Mother_Gastro	Mother tuber of Gastrodia elata	8.10
	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	9.50