Gene detail

Detail information of GWHGAAEX014114/evm.TU.scaffold_56.95

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000066	3616783	3622828	+

Transcript Sequence
>GWHTAAEX014114 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Network for GWHGAAEX014114

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation
Module13

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
--	--	--	--	--

Protein Sequence

Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	9.000
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	6.890
SRP108465	SRR5643513	five period of Gastrodia elata	5.590
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	SRR5643524	five period of Gastrodia elata	6.250
	SRR5643525	five period of Gastrodia elata	10.150
	SRR5643528	five period of Gastrodia elata	8.200
	SRR5643658	five period of Gastrodia elata	7.880
	SRR5643659	five period of Gastrodia elata	13.280
	SRR5643660	five period of Gastrodia elata	5.740
	SRR5643661	five period of Gastrodia elata	5.670
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	SRR5643663	five period of Gastrodia elata	10.750
	SRR5643664	five period of Gastrodia elata	58.660
SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	62.870
	SRR6049655	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	24.860
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	SRR6049657	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	44.570
	SRR6049658	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	32.360
	SRR6049659	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	39.370
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	SRR6049661	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	57.280
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	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	65.380
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	34.900
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	34.900
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	21.01
	Juven	Juvenile tuber	2.05
	Mother_Gastro	Mother tuber of Gastrodia elata	24.00
	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	9.97