Gene detail

Detail information of GWHGAAEX017850/evm.TU.scaffold_88.32

Functional Annotation

Database	Orthologs	E value	Annotation
nr	gi\|743857275\|ref\|XP_010942079.1\|	2.74E-70	PREDICTED: uncharacterized protein At5g64816 [Elaeis guineensis]
Swissprot	tr\|Q8L8Q8\|Y5486_ARATH	7.00E-67	Uncharacterized protein At5g64816 (Precursor)
trEMBL	tr\|A0A096RU88\|A0A096RU88_MAIZE	7.00E-70	Uncharacterized protein {ECO:0000313\|EnsemblPlants:GRMZM2G113401_P02}
TAIR	AT5G64810_3	2.00E-66	Unannotated protein

Location And Transcript Sequence

Scaffold	Start	End	Strand
GWHAAEX00000095	679834	686924	-

Transcript Sequence
>GWHTAAEX017850 ACGATTCAGGTGGTTCTCATACACCACGCATCGTTCCAGAAATTGTGAAGATGGGCTAAATCCTGAACTCTCTGTTTGGGTTGTTGGTGTTCTTTTGAACAACACCACTGCATTGTGAGGTTTAAGCCATTATATAATTAAAGTGAAGGAAGAATCATCAGTTTGCACCAAGCAGTAGGTATATGTATTTTTTTTATCTTTGTTTTTCTTGTATTAACATTGTATAGTAATTATATAATTAAAGAGTAAATAGGAGTATGAATACAAATTTTGATAACAAAACACATGTTGCAATATAGATTTTATATTTTCTTAACAATACACATTTGTAATCTTTAACAGATAAATATATCAGGAGACATGCTTTAGTTGCCACTTAGTTTTACCAACTAACACTGCCACTTTGTTTTAGAATAGCTTTGATTTTGTTAGGATTTCTGTTTGGTGTATGGTAATGTTGATTTTGCAGCTAGAGCGCAATAGCTGGCCCTTGAAACTCCCTGATGAAAATTAAAATTATAGCCAAGGCAGATTAAATTAAGAAATTGTTTCTAAGCTTTATAGCATGTGCAAATGAAGCAGGAAAAAAAAAATCCAAAGTAGGAAGGAATCTAAAATCTTTTTTCTCTCTTTGCTTGATAAAGATTTAAATGAAGGAGAATTTGGTTAAATTATTAAAAGAAAAATTTGTTTTGCATGAGATCTTTTATTCAAAACTCAAATTCTTTGTGCTTATCTTTTTTTGGAAGAAGTTTGTGCTTATCTTTAAATATCAGTTTTACATACGCAAATGGTTTAATTTTCATCAAGGGGAGTTCAACCAGCAATTGTGTTTTTGCCTACAAAATCACATCACTATACTCTGAACATAAGTTTTAACAAATTAACGCTAAGCTAAAGGCAAGTGGCAAAGTTGGTTCGTAAAACCAAGTGGCAGATAAAAACAAATGTCTCCTGATATATTTGTTTGTTAAACAGATTGTGCTTTGGTGTGTGACAATATTTTGCATTACTCAAAATGTGAAGCAATGGTGACCAAATTGTTGACTCTTCTTCTTGTTCTGGTGTGTGTTAAAGATTTGCATTATTCAAATAATGTCTTCCCCTTTTTACATTATTCTTCTATATTTATAGCTGTTTAATTTTTTTAGAATTTCTTACATTGTTATAGTTATTGTTGACTCTTCCTCTATATTTATAGTTATTGATTTTTCTTAGAAGTTCTTACCTTATGTTAGAAAAATTTAAAATGCTCAATTTTTTTTTCAATGATTTCACATGCTGACACACTAGAATCTTAAATTTTGTTACTTTTATATATAAACTATTTAAGTTTTTTTAATCTAAGCTTACAAAACCTTTTCTTCTTTTTCAGCATCATCTTCTTTAAAACTTTGTAAAAACCATAAGGGCTGTTTATTTTAGGATTAAATTTTGTAAATATATAGATTAGAAATTAATTAAGCTTTGTTAATAAATTTGTTCAGTTTGATTTTCTTGATCTTTTACTTTTAGTTTTTTTAATATATGCTGAATAAGGTAAGCTAAGTTTTGGCTTGCAGGAGATCCAAATAACATAATCCAAGAGTCGGTGAATTGATTTGCTTTGACTTATAAAAAAAATAAAACTTGGAACTTAAGAAAAGAAACTAAAATTTGAGAGACTAAAATTTCACAGGCCACATGCACAATCTTGAAAAGAAAAATACAAAAAATTAAAATAAAAAGAACACATTAGGTTTACAGTGGTTCTAGTTAATTTTTTTTTAAGGTTTACCTTTTTTGAAAAGCACTCGGAGTCTCTTTTTTGTTTCTAAGAAGCATTGGAGCAAACCTTTATTGAACAAACTTTGGCACTAGAGTTGTCAAGATTACTCTTCTTCCCAAAGCTTTATTGAGGCAAAGCTATATAAAAATTTTCTTTTGCACAACCCTCAAAATAGGGCTAAGAAAACCAAAAGGATATTACCAAAATATAAAAACTTCCAATTTTGACGTGAAGTCTTCAAGATTGTCGAGCTTTTTATGTTTTGATAGAACTTTGAAAGCTTTATAGGAGAGCCCTAGGAACGTTAGAAGTTACTATATCACTTAGAAGACCCAAGTGTGTTTAACTGTTGGAAAATTAAAACTTTGATTTAAGGAGAGCAAGAAAATAATTTGAGAGATTAATTTCTTAGGTTATCCACCATAAATTTAAAATAAAGAAACACAAAGGAAAGAAAAAATAAAATGAACACGTTAATTCTATATTTGTTAGAATCAAAATCTTATACTCTACGTCCACTTTCTAAAGGTTTGTCTCCTTCAGGATTTCACTTGCAATCAGAGTTGCTTCTTTGCTATTAAATGCAGGTTGAGAAGTCTTGGAACAAGCCTTTCCTAAGCAAATGTTGGTAAAGTTTTTGAGGTTATCCTCCTCCCCAAAGCTATGCTATGGTAGAGTTCTTGATAACTGTTTTTCATAACCTGCAAGAGTTGATTAAGAAAAATAAAAGTAGAGAAACGTCCCAGCAAATAAATAAAAAGTTTGATAAAAGTTTAGGTGTTTATTAAAAATAAAGAGGGAAATTTACTAATGACCCAAAATTATAAGTGCATCACACTAATCTCATTCTTACAAATAAGAAATGCCATATCATCAAGCTTAACTTTTATCTTAATTTTGCTCTGTGGCAAAAAAATTTAGAGAACTTTGAGCGCTTTTGGAGAGCTTTTGGAGACTTGTTAGATACTAGATCACGTAGAAGATGTTTTGGAATTTCTTGGGGATGAGTGGAAAGGTCAGGAAATACTCGTTATTTGTAGGTGAAGAGGTTGAATTAGGCATGTTGGAAATATTGGGTAACAAGACATGTTTGGGTGTGATGCTAGACGCACTTGGGCTTGTGATTGGTGATGGTGGTCTGTTTTTTTATGGTCCGCGAGATCGTGTTTTGGCAGGGTATCCGTCTAACTATAGATCGGCCTGACAAAACTTGGATGCGCTTGGGCACAATTGTTCACAAACTTGGGTATATGGGCTCACACTCCTTGTAGCTTATGGTCCAATTTTTAGTGTTCACGTAAAATGGCTAAACTTTCTAATTGCTCCAGTCTCTTAAATTTTAGTTTGCAACTTAAGTCTAAAGCCACGGCTAATATATATAATTGCATTTATTATAAACTTAAGGTATAAAATAAAAATCTCAAGTTTGTGAGCATGTTAATGATGTTTAGTGCTACATTACTCAAGCCTTTTTTTTCTATCTTTTGCTTTGGTGGTTTCTTAAGTGCATCATCTAGTTTAATATTTGAAGTTAGTCTCATTAGCTTAACTTTTAAATTTGAATTATCTCAGACTTGTTTAGATTTTTGTCTCTGAGCATTTGAGATTATCTAATAGATTGAGTAACTAAAGCTTAGTGCTATAATGTGAGATAACTTTCCTTAAATACATCAACAAATAATAGTACACATCAAAAGCTATATTTTATGTTTTGTTATCAGCAAAGTTATGGCATCCAAAAATATGTCATGTGTATTTATGACTCTCTGAGTCAATAAAGTTGGCAAGTTATGCAGGTGTAGTTGGTGCCCCTGTGACATAAGTCAGTTCAAATCATCCTAATAAATTAAATTGCTAGTTTGTCAATATACAGAATAAAATTATGAATATCATCAACATCAATATTTAGATACCAACCATTATAAATTGAATGATTATCAATGTCATACTCAATAATGGTGGTTAATCGACTTAAATTTTATTTTCTGACAATTAATGGAAATAAATAATTTCCTTTATTGACATATAGTATTGAGCTAGCGATAAATTATTTTACCAAAATTAAATTAGCAAGTCAAGCCAAACTAGTTTTAAATTGAGTTAATGGAAATTGAGAGTTTAATGTAAAAATCAATCACCACCCAAGGCATAAATAAAATTTTACTTAAGTGCCAAATAAATACCAATGTTCTATGTGGTTATTTTATGGATGAATTTAATGAAATGATATAAGAAATCAAGACAACTAAATACGTAGACAATTTTGAGGAGTTGTGCATTATGAAATAGACAAAAACCCAAAGTCACAGTTTTTAGGTTTGAGAACGAACCTATAAAAATAAGAGAGAAATGATCCAACGTTAGATTGATTTAATTGAATACGCATGCTGACCTCTTGAGTCATAATTTTATACATAAAACATCAACCACATTATAAAACCGTTACACATGAGATCACCTAAGTTTGTTTTACGCATTCACCTACCACATTTAACAATAGTAGCACCATCATTAAAAGGGAGCCTATTGGAATATTTGTAATACTTTCTTTAGGATCCAAAGTAGGTATCAATCCAAACTAACAATGTTATCAAATTGAACATTATTTCAAGGAGTCTCTAGCTAGGAGCCTAAAAATATACGCATCTTTATACTATTTTTTGGTGGTTTACTGTCTAGGAATTCCAGCGCTGGACAGCTAAGTTTAGTCACATTAATAACTCAAAGTAACTTACCCAAACGATGATACTGCTCAAATAATTTGGATTTTGGGGTGTCAAATAATTGAAAATATCTTAGATAAATTTATTGAATTTTCATCTCTATCAACTGCTATGATTTTTTGTTTTAATTAATATGTAATTTGCTTGTCATTGCTTATAAAATAAATGATCTATTTTTCCAACTTAGTGTAACGATCTTATACGCTGCATTTTCCTCTGAGAATCTCCTAATGATCACTGAGAGTTGTTCTTAATCCTGTTGTAAATTAGTATATCATTAAAGTGATTTTTTTAAATTCTTTTATTGTATGGACAAAATACATGGTTTTCATGCTTATATATGTATTGAGTGCTTTGGATAATTTAAAGGCATGACAACCATTTTTTAAAAATCCTTCGGTCAATGTCAGATGTATGAGAACAACACATGGAGTCATAACAAATTTTTTTTAAAGTAATTCATCTACTCATCTCTCTAAATCAGTGTCTTTAGTGGATGTGATCTTAAT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Network for GWHGAAEX017850

Network category	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Positive	Network	Top300 PCC genelist
Coexpression Negative	Network	Top300 PCC genelist

Functional Module

Module ID	Function Annotation

Protein Structure

Pfam accession	Pfam name	Alignment start	Alignment end	E-value
--	--	--	--	--

Protein Sequence

Gene family

Gene family	subfamily
--	--

KEGG pathway

KO	Enzyme	pathway	mapID
--	--	--	--

Gene Ontology

GO term	Ontology	Name

Expression pattern

SRP	Sample	Description	FPKM
SRP064423	SRR2545914	vegetative propagation corms	3.970
SRP064423	SRR2545915	Juvenile tuber	5.440
SRP108465	SRR5643513	five period of Gastrodia elata	5.480
	SRR5643514	five period of Gastrodia elata	5.980
	SRR5643515	five period of Gastrodia elata	5.620
	SRR5643524	five period of Gastrodia elata	5.640
	SRR5643525	five period of Gastrodia elata	3.770
	SRR5643528	five period of Gastrodia elata	3.510
	SRR5643658	five period of Gastrodia elata	3.520
	SRR5643659	five period of Gastrodia elata	9.180
	SRR5643660	five period of Gastrodia elata	9.590
	SRR5643661	five period of Gastrodia elata	8.590
	SRR5643662	five period of Gastrodia elata	8.970
	SRR5643663	five period of Gastrodia elata	10.070
	SRR5643664	five period of Gastrodia elata	9.280
SRP118053	SRR6049654	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	4.800
	SRR6049655	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	3.340
	SRR6049656	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	4.760
	SRR6049657	Rhizomagastrodiae_C368-T07_good_1	4.780
	SRR6049658	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	4.170
	SRR6049659	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	3.760
	SRR6049660	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	4.030
	SRR6049661	Rhizomagastrodiae_C368-T04_good_1	4.380
	SRR6049662	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	4.630
	SRR6049663	Rhizomagastrodiae_C368-T01_good_1	4.250
	SRR6049664	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	4.990
	SRR6049665	Rhizomagastrodiae_C368-T10_good_1	4.990
SRP279888	Gastro	Gastrodia elata tuber	11.96
	Juven	Juvenile tuber	5.99
	Mother_Gastro	Mother tuber of Gastrodia elata	5.39
	Mother_Juven	Mother tuber of Juvenile	6.58